Metabolismo humano: novos bancos de dados

Os cientistas que lidam com o metabolismo humano têm agora duas novas ferramentas para ajudá-los melhor entender esse processo.

O banco de dados bioquimica, genetica e genomicamente estruturado (Biochemically, Genetically, Genomically − BiGG em inglês) desenvolvido por Bernhard Palsson e colaboradores na Universidade da Califórnia − San Diego inclui dados para ~3300 reações metabólicas.

Conforme os pesquisadores demonstram, esses dados podem ser usados para construir modelos de metabolismo em sílica para estudos de sistemas de biologia (PNAS − Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 1777–1782). http://www.pnas.org Acesso gratuito.

A outra ferramenta, chamada em inglês de Human Metabolome Database (HMDB) [Banco de Dados de Metaboloma (?) Humano], foi compilado por David Wishart e colaboradores na Universidade de Alberta, Universidade de Calgary, e o National Institute for Nanotechnology [Instituto Nacional de Nanotecnologia], todos no Canadá.

O HMDB contém informação relevante sobre ~2500 metabólitos encontrados na urina, sangue, e fluído cerebrospinal (Nucleic Acids Res. 2007, 35, D521–D526).
Os dois recursos contêm um tesouro escondido de dados esperando para ser minerado.

O texto completo pode ser baixado gratuitamente aqui.