The Phylogenetic Forest and the Quest for the Elusive Tree of Life
1. E.V. Koonin, 2. Y.I. Wolf and 3. P. Puigbò-Author Affiliations
1. National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland 208941. Correspondence: koonin@ncbi.nlm.nih.gov
Abstract
Extensive horizontal gene transfer (HGT) among prokaryotes seems to undermine the tree of life (TOL) concept. However, the possibility remains that the TOL can be salvaged as a statistical central trend in the phylogenetic “forest of life” (FOL). A comprehensive comparative analysis of 6901 phylogenetic trees for prokaryotic genes revealed a signal of vertical inheritance that was particularly strong among the 102 nearly universal trees (NUTs), despite the high topological inconsistency among the trees in the FOL, most likely, caused by HGT. The topologies of the NUTs are similar to the topologies of numerous other trees in the FOL; although the NUTs cannot represent the FOL completely, they reflect a significant central trend. Thus, the original TOL concept becomes obsolete but the idea of a “weak” TOL as the dominant trend in the FOL merits further investigation. The totality of gene trees comprising the FOL appears to be a natural representation of the history of life given the inherent tree-like character of the replication process.
Copyright © 2009, Cold Spring Harbor Laboratory Press
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NOTA CAUSTICANTE DO BLOGGER:
Árvore da Vida ilusória??? O conceito de Árvore da Vida de Darwin se torna obsoleta??? Caracas, mano, acho que uma hora dessas os agentes da KGB (revisores) da Nomenklatura científica devem estar fazendo enorme pressão sobre Koonin que ousou ir de encontro com uma das maiores ideias que toda a humanidade já teve: o ancestral comum...
Num sei não, mas acho que tem muito nego e nega que uma horas dessas deve estar bufando de raiva deste blogger. Eu num tô nem aí pra ocês, sô!!! Para mim, contrariando Dobzhansky, um Darwinista de Cristo, o que vale são as evidências, que se dane a teoria!!!
É por essa e outras que, há pouco mais de uma década, eu sou pós-darwinista.
P.S.: Traduzi elusive por ilusório, mas pode ser traduzido também como muito difícil de compreensão. Para mim, muito difícil de compreensão é milagre, e milagre não faz parte da ciência. Ou será que há rumores de anjos na epistemologia???
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P.S.: Traduzi elusive por ilusório, mas pode ser traduzido também como muito difícil de compreensão. Para mim, muito difícil de compreensão é milagre, e milagre não faz parte da ciência. Ou será que há rumores de anjos na epistemologia???
