Homenagem a Otto Gottlieb

terça-feira, julho 05, 2011

05/07/2011

Por Fábio de Castro, de São Carlos (SP)

Agência FAPESP – Na abertura dos eventos no 7º Simpósio do Programa BIOTA-FAPESP, que ocorreu nos dias 4 e 5 de julho, no campus da Universidade de São Paulo (USP) em São Carlos, Vanderlan Bolzani, professora do Instituto de Química de Araraquara da Universidade Estadual Paulista (Unesp) e membro da coordenação do Programa BIOTA-FAPESP, fez uma homenagem ao químico, pesquisador e professor Otto Richard Gottlieb, falecido no dia 20 de junho, com a palestra “Uma vida dedicada à compreensão da complexidade molecular da biodiversidade”.



Simpósio do Programa BIOTA-FAPESP, em São Carlos, homenageia o cientista, morto em junho, que dedicou-se à compreensão da complexidade molecular da biodiversidade (BV Otto Gottlieb)

Orientanda de Gottlieb no mestrado e no doutorado, Bolzani lembrou que o cientista, nascido em 1920 na então Tchecoslováquia, foi considerado o maior nome em química de produtos naturais da América Latina. Foi indicado em 1999 ao prêmio Nobel, por seus estudos sobre a estrutura química das plantas, que permitem analisar o estado de preservação de vários ecossistemas. O cientista se instalou no Brasil a partir de 1939.

“Em 1967, Gottlieb apresentou, no Instituto de Química da USP, a palestra ‘Jacarandá – 400 anos de carpintaria, 4 anos de química’. O conteúdo entusiasmou o corpo de docentes do instituto de tal forma que eles montaram, com verba da FAPESP, o Laboratório de Química de Produtos Naturais, que até hoje produz uma das mais importantes atividades científicas daquela unidade. Foi ali que Gottlieb se aposentou em 1990”, disse.

Segundo Bolzani, Gottlieb era um apaixonado pela biodiversidade em geral e, em particular, pela biodiversidade do bioma da Amazônia. “Com base em alguns táxons da Amazônia, ele construiu um belo trabalho não apenas de fitoquímica, mas produziu dados que mais tarde procurou associar à química, fazendo um pioneiro trabalho de filogenia”, disse.

Bolzani destacou um importante artigo publicado em 1999 por Gottlieb na revista Química Nova, do Instituto de Química da USP, intitulado “Biodiversidade – uma teoria molecular”.

“Ele dedicou sua vida ao estudo de espécies arbóreas da Amazônia, porque havia pouco conhecimento sobre essas espécies, além de uma acelerada devastação do bioma”, afirmou.

Também em 1999, Bolzani e Gottlieb participaram da Conferência Internacional da União Internacional da Química Pura e Aplicada (Iupac, na sigla em inglês), que foi realizada em Belo Horizonte (MG). Segundo Bolzani, durante aquele evento, o BIOTA-FAPESP foi oficializado como um programa da FAPESP. Gottlieb teve uma participação efetiva, segundo ela, no nascimento do programa.

“Foi um grande incentivador na carreira de vários orientandos, em especial na minha e na do professor Massuo Kato, do Instituto de Química da USP, que iniciava, então, sua trajetória científica. Em 1999, no primeiro workshop do BIOTA-FAPESP, chegamos a discutir com Gottlieb a importância de se realizar simpósios para os jovens, trazendo colaboradores do exterior para interagir com eles. É o que estamos vendo aqui hoje”, disse Bolzani, emocionada.

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NOTA DESTE BLOGGER:

O artigo “Biodiversidade – uma teoria molecular” de Gottlieb pode ser baixado gratuitamente aqui.

As flutuações do genoma em cianobactérias refletem traços evolucionários, de desenvolvimento e de adaptação

Genome fluctuations in cyanobacteria reflect evolutionary, developmental and adaptive traits

John Larsson , Johan AA Nylander and Birgitta Bergman

BMC Evolutionary Biology 2011, 11:187doi:10.1186/1471-2148-11-187

Published: 30 June 2011

Abstract (provisional)

Cyanobacteria belong to an ancient group of photosynthetic prokaryotes with pronounced variations in their cellular differentiation strategies, physiological capacities and choice of habitat. Sequencing efforts have shown that genomes within this phylum are equally diverse in terms of size and protein-coding capacity. To increase our understanding of genomic changes in the lineage, the genomes of 58 contemporary cyanobacteria were analysed for shared and unique orthologs.

Results

A total of 404 protein families, present in all cyanobacterial genomes, were identified. Two of these are unique to the phylum, corresponding to an AbrB family transcriptional regulator and a gene that escapes functional annotation although its genomic neighbourhood is conserved among the organisms examined. The evolution of cyanobacterial genome sizes involves a mix of gains and losses in the clade encompassing complex cyanobacteria, while a single event of reduction is evident in a clade dominated by unicellular cyanobacteria. Genome sizes and gene family copy numbers evolve at a higher rate in the former clade, and multi-copy genes were predominant in large genomes. Orthologs unique to cyanobacteria exhibiting specific characteristics, such as filament formation, heterocyst differentiation, diazotrophy and symbiotic competence, were also identified. An ancestral character reconstruction suggests that the most recent common ancestor of cyanobacteria had a genome size of approx. 4.5 Mbp and 1678 to 3291 protein-coding genes, 4%-6% of which are unique to cyanobacteria today.

Conclusions

The different rates of genome-size evolution and multi-copy gene abundance suggest two routes of genome development in the history of cyanobacteria. The expansion strategy is driven by gene-family enlargment and generates a broad adaptive potential; while the genome streamlining strategy imposes adaptations to highly specific niches, also reflected in their different functional capacities. A few genomes display extreme proliferation of non-coding nucleotides which is likely to be the result of initial expansion of genomes/gene copy number to gain adaptive potential, followed by a shift to a life-style in a highly specific niche (e.g. symbiosis). This transition results in redundancy of genes and gene families, leading to an increase in junk DNA and eventually to gene loss. A few orthologs can be correlated with specific phenotypes in cyanobacteria, such as filament formation and symbiotic competence; these constitute exciting exploratory targets.

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Ranking das ciências sociais

05/07/2011

Agência FAPESP – O QS World University Rankings by Subject: Social Science, que acaba se ser divulgado no site TopUniversities (www.topuniversities.com), traz sete universidades da América Latina entre as 200 principais no mundo em ciências sociais.

É a primeira vez que os QS World University Rankings listam universidades por assunto ou disciplina acadêmica. Foram listadas 26 disciplinas, com base em “reputação acadêmica”, “reputação da instituição” e “citações por artigo” (base Scopus).



QS World University Rankings lista as 200 principais universidades no mundo em ciências sociais. Cinco são brasileiras (QS)

As disciplinas foram reunidas em seis áreas principais: Contabilidade e Finanças; Economia; Direito; Estudos Internacionais e em Política; Estatística e Pesquisa Operacional; e Sociologia.

Os rankings listam as universidades de 1ª a 50ª e, a partir dali, em faixas de 50. A Universidade de São Paulo ficou na faixa 51 a 100 em Sociologia e de 151 a 200 em Estudos Internacionais e em Política.

A Universidade Estadual de Campinas ficou na faixa de 101 a 150 em Estatística e Pesquisa Operacional. A Universidade Federal do Rio de Janeiro também ficou entre 101 a 150 em Estatística e Pesquisa Operacional e aparece entre os 151 e 200 em Sociologia.

Em Estudos Internacionais e em Política, a Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro ficou de 101 a 150 e a Fundação Getúlio Vargas de 151 a 200.

A mais elevada posição no ranking de uma instituição latino-americana foi o 44º lugar ocupado pela Universidade Nacional Autônoma do México em Sociologia.

“Com sete universidades entre as 200 principais no mundo em ciências sociais, as universidades da América Latina demonstram sua força em temas individuais nos novos rankings”, disse Ben Sowter, que chefia a Unidade de Inteligência na QS.

No geral, a Universidade Harvard, nos Estados Unidos, ficou em primeiro em cinco das seis áreas e em 16 das 26 disciplinas. A única área em que Harvard não liderou foi Estatística e Pesquisa Operacional, na qual a Universidade Stanford ficou em primeiro.

A QS (Quacquarelli Symonds) é uma empresa especializada na produção de informações e estatísticas para o ensino superior.

Mais informações: www.topuniversities.com

Ué, cadê o tal de aquecimento global? O gato das evidências científicas comeu!!!

Reconciling anthropogenic climate change with observed temperature 1998–2008

Robert K. Kaufmanna,1, Heikki Kauppib, Michael L. Manna, and James H. Stockc

aDepartment of Geography and Environment, Center for Energy and Environmental Studies, Boston University, 675 Commonwealth Avenue (Room 457), Boston, MA 02215; 
bDepartment of Economics, University of Turku, FI-20014, Turku, Finland; and cDepartment of Economics, Harvard University, 1805 Cambridge Street, Cambridge, MA 02138

Edited by Robert E. Dickinson, University of Texas at Austin, Austin, TX, and approved June 2, 2011 (received for review February 16, 2011)

Abstract

Given the widely noted increase in the warming effects of rising greenhouse gas concentrations, it has been unclear why global surface temperatures did not rise between 1998 and 2008. We find that this hiatus in warming coincides with a period of little increase in the sum of anthropogenic and natural forcings. Declining solar insolation as part of a normal eleven-year cycle, and a cyclical change from an El Nino to a La Nina dominate our measure of anthropogenic effects because rapid growth in short-lived sulfur emissions partially offsets rising greenhouse gas concentrations.

As such, we find that recent global temperature records are consistent with the existing understanding of the relationship among global surface temperature, internal variability, and radiative forcing, which includes anthropogenic factors with well known warming and cooling effects.

aerosol emissions ∣ carbon emissions ∣ coal consumption ∣ black carbon ∣ stratospheric water vapor

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NOTA DESTE BLOGGER:

Que o clima está muito maluco, isso ninguém pode negar. Todavia, sempre fui cético localizado do aquecimento global ser um fenômeno antropogenicamente provocado. Temos a nossa parcela de culpa, mas o fenômeno não é UNICAMENTE provocado pelo homem. É simplesmente um fenômeno natural cíclico.

Será que a Grande Mídia dará destaque a este estudo que contraria as posições de Al 'Apocalipse' Gore e seus discípulos??? Pagar para ver... Talvez tenha que morder a língua. 

Transferência para a USP

05/07/2011

Agência FAPESP – Estão abertas, até o dia 8 de julho, as inscrições para os exames de transferência externa para a Universidade de São Paulo (USP).

Podem participar do processo estudantes de cursos superiores do Brasil e do exterior, exceto graduandos de cursos sequenciais. Alunos com matrícula trancada poderão se inscrever, contudo, se forem aprovados, deverão estar regularmente matriculados no primeiro semestre de 2012 na escola de origem.



Estão abertas até 8 de julho as inscrições para os exames de transferência externa para a Universidade de São Paulo (Marcos Santos/USP Imagens)

No total, são oferecidas 1.101 vagas. O processo de transferência conjunto USP/Fuvest será realizado para o preenchimento de 975 vagas, assim distribuídas: 128 na área de biológicas, 541 na área de exatas e 306 na área de humanidades.

O manual do candidato pode ser acessado no site da Fuvest. A instituição aplicará as provas da primeira etapa. O candidato classificado fará a segunda etapa na escola que oferece o curso escolhido. As normas e os programas dessa segunda fase constam de edital que está disponível para consulta nas respectivas seções de alunos e no site da Pró-Reitoria de Graduação.

As inscrições devem ser feitas exclusivamente pelo site da Fuvest. O pagamento da taxa de inscrição, no valor de R$ 100, poderá ser feito em qualquer agência bancária, até o dia 11, por meio do boleto gerado no ato de inscrição.

A prova da primeira etapa tem duração de quatro horas. Será aplicada pela Fuvest no dia 31 de julho, com início às 12h30min, e consta de 80 questões de múltipla escolha. A convocação dos candidatos para a segunda etapa será feita no dia 12 de agosto.

Os processos de transferências para cursos do Instituto de Física de São Carlos (IFSC) e para os cursos de Ciências Sociais, Filosofia e História da Faculdade de Filosofia Letras e Ciências Humanas (FFLCH) da USP estão em andamento nas respectivas instituições de ensino.

Mais informações: www.fuvest.br

James Shapiro: revisitando a evolução no século 21

segunda-feira, julho 04, 2011



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LECTURE SLIDES PDF SLIDES DA PALESTRA

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NOTA DESTE BLOGGER:


Repare que Shapiro diz que o pessoal do Design Inteligente está certo em suas críticas ao darwinismo, mas não concorda com a nossa conclusão da necessidade de um designer. Ele precisa ler mais os teóricos do DI e perceber que esta não é a nossa proposta, mas que sinais de inteligência são detectados na natureza: complexidade irredutível de sistemas biológicos e informação complexa especificada -- como o DNA. O que é esta inteligência? Bem, a biologia do século 21 é uma ciência de informação, e informação até aqui é elaborada somente por inteligências...



Fui, nem sei por que, pensando no meu bom amigo Charbel Niño El-Hani. Por que pensei nele? Charbel é um dos especialistas em evolução mais abalizado no Brasil. E o que isso tem a ver com o meu pensar nele? Explico: após a palestra Design inteligente: Paley redivivus ou uma nova teoria cientificamente plausível? que apresentei no V Encontro de Filosofia e História da Biologia, na  Universidade Presbiteriana Mackenzie, em 10 de agosto de 2007, Charbel me interpelou dizendo que eu tinha entrado numa canoa furada: a do design inteligente. Respondi ao meu bom amigo que estava apostando todas as minhas fichas no cavalo do DI, e que Darwin estava se mostrando cada vez mais um pangaré epistêmico.

É o que parece estar dizendo Shapiro nesta palestra: Darwin, já era!!!

Margulis 'falou e disse': a explicação darwinista da evolução é uma meia verdade

"esta reivindicação darwiniana de que explica toda a evolução é uma meia verdade popular cuja falta de poder explicativo é compensada somente pela ferocidade religiosa de sua retórica... Nenhuma evidência na vasta literatura de mudanças hereditárias mostra evidência inequívoca de que a mutação aleatória em si mesma, até com o isolamento geográfico das populações, resulte em especiação" [Lynn Margulis, in "Acquiring Genomes: A Theory of the Origins of the Species," 2003, p. 29]

"this Darwinian claim to explain all of evolution is a popular half-truth whose lack of explicative power is compensated for only by the religious ferocity of its rhetoric... No evidence in the vast literature of heredity changes shows unambiguous evidence that random mutation itself, even with geographical isolation of populations, leads to speciation" [Lynn Margulis, in "Acquiring Genomes: A Theory of the Origins of the Species," 2003, p. 29]

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NOTA DESTE BLOGGER:

Eu experimentei e experimento desta "ferocidade religiosa de sua retórica" da parte da Nomenklatura científica na defesa canina de uma teoria científica que nunca foi corroborada pelo contexto de justificação teórica desde 1859. Eles sabem do que estou falando... Um dia escrevo sobre isso... nem sei se vale a pena, pois o que é bom em ciência é que ela é uma busca pela verdade. Ciência e mentira não podem andar de mãos dadas.

Nessa busca pela verdade, o que vai se revelar é que a atual Nomenklatura científica vai ser encontrada do lado do erro, da dissimulação, dos golpes baixos, do poder totalitário desses pitbulls de Darwin em destruir carreiras acadêmicas promissoras, da intimidação em salas de aulas nas escolas e universidades públicas dos alunos que são críticos e oponentes desta teoria mais furada do que queijo suiço, e este blogger vai ser encontrado do lado da verdade por ter questionado Darwin, e declarado: O rei está nu!!!



E pensar que o MEC/SEMTEC/PNLEM aprova a abordagem do fato, Fato, FATO da evolução com duas fraudes e várias distorções de evidências científicas. O nome disso é 171 epistêmico, desonestidade científica, e nenhum desses autores me processa por danos morais. Por que será, hein? É que eles sabem que Darwin irá para o banco dos réus comigo, e eles mesmo não querem passar mais vergonha de terem sido aqui denunciados não como educadores, mas como enganadores... Faltando coragem senhores???

Luisi sobre a contingência e o determinismo na origem da vida

domingo, julho 03, 2011

P.L. Luisi

Contingency and Determinism

The Royal Society, Phil. Trans. R. Soc. Lond. A, 361, 1141-1147, 2003

By Pier Luigi Luisi

Department of Materials, ETH Zentrum,

8092 Zurich, Switzerland

Published online 2 May 2003

Contingency versus determinism is an old, classic issue in the history of science, and certain trends of contemporary science literature appear to be bringing it to the foreground again.

Keywords: contingency; determinism; origin of life; prebiotic chemistry; proteins

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EXCERPT/EXCERTO


1. Inevitability


We generally accept the Oparin-Haldane scenario about the origin of life on Earth, according to which life was formed from inanimate matter throughout a long series of spontaneous steps of increasing molecular complexity, up to the formation of the ­ first self-reproducing protocells. From this scenario, any transcendent act or miraculous intervention is eliminated by definition.

How did this series of steps come about? One answer is in terms of determinism, according to which the laws of physics and chemistry determine the series of events sequentially and causally. Thus, in his book about the origin of life, Christian de Duve (1991) writes `given the suitable initial conditions, the emergence of life is highly probable and governed by the laws of chemistry and physics. . . ’.

This seems to lead one to the idea that life on Earth was inescapable, and in fact, in a more recent work (de Duve 2002), he restates this concept: `it is self-evident that the Universe was pregnant with life and the biosphere with man’. De Duve considers and discusses in this book the importance of contingency, but only limited to particular and secondary effects.

The idea of the inevitability of life on Earth, although phrased differently and generally with less emphasis, is presented by other signi­ cant authors, for example Herbert Morowitz, in his well-known book (Morowitz 1993, p. 12), states, `we have no reason to believe that biogenesis was not a series of chemical events subject to all of the laws governing atoms and their interactions’, adding also, interestingly, `only if we assume that life began by deterministic processes on the planet are we fully able to pursue the understanding of life’s origins within the constraints of normative science’ (Morowitz 1993, p. 3). He also adds a clear request against contingency: `we also reject the suggestions of Monod that the origin requires a series of highly improbable events and cannot be recovered from the laws of physics’ (Morowitz 1993, p. 13).

Orgel e a origem da vida: uma revisão de fatos e especulações

Trends in Biochemical Sciences
Volume 23, Issue 12, 1 December 1998, Pages 491-495

Reviews

The origin of life—a review of facts and speculations

Leslie E. Orgel*

Salk Institute for Biological Studies, 10010 N. Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037, USA.

Available online 22 September 1999. 

Abstract

Three popular hypotheses attempt to explain the origin of prebiotic molecules: synthesis in a reducing atmosphere, input in meteorites and synthesis on metal sulfides in deep-sea vents. It is not possible to decide which is correct. It is also unclear whether the RNA world was the first biological world or whether some simpler world preceded it.

Author Keywords: prebiotic synthesis; reducing atmosphere; carbonaceous chondrite; deep-sea vent; RNA world.

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Orgel e a química pré-biótica e a origem do mundo RNA

Crit Rev Biochem Mol Biol. 2004 Mar-Apr;39(2):99-123.

Prebiotic chemistry and the origin of the RNA world.

Orgel LE.

SourceThe Salk Institute, La Jolla, California 92097, USA. orgel@salk.edu

Abstract

The demonstration that ribosomal peptide synthesis is a ribozyme-catalyzed reaction makes it almost certain that there was once an RNA World. The central problem for origin-of-life studies, therefore, is to understand how a protein-free RNA World became established on the primitive Earth. We first review the literature on the prebiotic synthesis of the nucleotides, the nonenzymatic synthesis and copying of polynucleotides, and the selection of ribozyme catalysts of a kind that might have facilitated polynucleotide replication. This leads to a brief outline of the Molecular Biologists' Dream, an optimistic scenario for the origin of the RNA World. In the second part of the review we point out the many unresolved problems presented by the Molecular Biologists' Dream. This in turn leads to a discussion of genetic systems simpler than RNA that might have "invented" RNA. Finally, we review studies of prebiotic membrane formation.

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Janet Browne ‘falou e disse’: Darwin abordou a origem e evolução das espécies de modo não empírico

sábado, julho 02, 2011

“Em uma era quando os filósofos naturais estavam conscientemente chegando a se apoiar em linguagens de predição, experimento, demonstração, e descoberta, quando as verdades acreditadas da natureza eram estabelecidas pelo ver e crer, a abordagem de Darwin era duplamente incomum. Ele estava convidando as pessoas a crer em um mundo governado pelas contigências irregulares e impredizíveis, bem como pedindo a elas que aceitassem sua solução pela simples razão que ela parecia funcionar.” — Janet Browne, Charles Darwin: The Power of Place (Princeton, 2002), p. 56, descrevendo a abordagem não empírica de Darwin usado no Origem das Espécies há 150 anos atrás. 


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“In an era when natural philosophers were consciously coming to rely on idioms of prediction, experiment, demonstration, and discovery, when accredited truths of nature were established by seeing and believing, Darwin’s approach was doubly unusual. He was inviting people to believe in a world run by irregular, unpredictable contingencies, as well as asking them to accept his solution for the simple reason that it seemed to work.” —Janet Browne, Charles Darwin: The Power of Place (Princeton, 2002), p. 56, describing the un-empirical approach Darwin used in the Origin 150 years ago.

Cientista ateu, aposentado, oferece US$ 50.000,00 para quem descobrir a origem da vida

ORIGIN OF LIFE RESEARCH AWARD

$50,000 AWARD FOR BEST PROPOSAL
$2,000,000 in Potential Research Funding


The sponsor named below is offering an award of $50,000 for the best original proposal pertaining to the study of the origin of life on Earth, including an outline of work to be performed in support of the proposal. Multiple awards may be made. "Life" is defined here as a self-sustained chemical system capable of undergoing Darwinian evolution. The proposal should take into account the conditions, materials, and energy sources believed to have existed on the prebiotic Earth. Submissions should provide a cogent hypothesis for how life first arose, including its plausible chemistry, and for how primitive life could have evolved to modern biological cells, including the present genetic material and metabolism. Submitters are encouraged to offer unconventional hypotheses that nonetheless can be subject to experimental validation. Specific questions to be addressed include:

What were the nature and genesis of the first macromolecules on the prebiotic earth? How did the building blocks that comprise these macromolecules become available and how were they assembled?

How did prebiotic molecules first acquire the capacity for storing genetic information and how did the genetic machinery evolve?

At what stage in the origin of life did cells originate, and what did they contain? How did those primitive cells evolve to modern biological cells?

What was the chemistry of the first metabolic pathway(s) and how did that metabolism evolve to modern cellular metabolism?

At what stage did proteins become involved in metabolic processes and how did the link first arise between genetic molecules and other functional molecules, such as enzymes?

All submissions will be reviewed by a panel of scientific experts. Submissions should contain a statement of work to be performed and a letter of institutional support where appropriate. Submissions that suggest a multidisciplinary approach should describe how the necessary research capabilities will be provided. Submissions that rely on extraterrestrial sources of key materials must describe in detail how those materials would have been generated. Submissions involving the supernatural or that violate physical laws will not be considered.

Submissions that are deemed highly meritorious by the reviewing panel will be eligible for additional research funding of up to $2,000,000 over a multi-year period, at the discretion of the sponsor.

Electronic submissions are requested. All submissions shall be in English (minimum 10 point type) and limited to 10 single-spaced pages, including figures, but excluding citations. Submissions will be accepted beginning July 1, 2011, with a final deadline of December 31, 2011. The confidentiality of all proposals will be protected using guidelines established by the U.S. National Science Foundation. The winner(s) will be announced and the award(s) will be made early in 2012. Until that time, the funds for the award are being held in a trust account by the law firm of Hurley Re, PC. Confirmation may be obtained by email to: OriginofLifeAccount@hurley-re.com.

To make a submission, please follow the Instructions for Submissions.

Harry Lonsdale
Sponsor

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My goal in supporting Origin of Life research is to help scientists solve one of the great remaining problems in biology. A solution will give every science teacher in the world, from high school to college, a fundamental understanding of how life probably began on the Earth. In time, the world will learn that the laws of chemistry and physics, and the principle of evolution by natural selection, are sufficient to explain life's origin.


-- Harry Lonsdale



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NOTA DESTE BLOGGER:

Qualquer cientista brasileiro pode ganhar o prêmio acima e um de US$ 1.000.000,00 se explicar cientificamente como foi a origem da vida. Quem for cientista muito, mas muito inteligente candidate-se aqui e leve esta bolada em dinheiro.

Eu? eu vou ficar assistindo de camarote vendo os cientistas no mundo inteiro correr atrás do vento como fazem há várias décadas desde o século 20.

Im eshkachech Yerushalayim - Yaakov Shwekey



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Para, por e com Israel, sempre! Apesar de [preencher as lacunas]

Mysterium tremendum em biologia evolucionária: como os traços complexos evoluem??? Como???

sexta-feira, julho 01, 2011

Wings, Horns, and Butterfly Eyespots: How Do Complex Traits Evolve?

Antónia Monteiro*, Ondrej Podlaha

Citation: Monteiro A, Podlaha O (2009) Wings, Horns, and Butterfly Eyespots: How Do Complex Traits Evolve? PLoS Biol 7(2): e1000037. doi:10.1371/journal.pbio.1000037

Published: February 24, 2009

Copyright: © 2009 Monteiro and Podlaha. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Funding: We thank the National Science Foundation (NSF IOB–0653399) for financial support. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.

Abbreviations: CRE, cis-regulatory element

* To whom correspondence should be addressed. E-mail: antonia.monteiro@yale.edu

Antónia Monteiro and Ondrej Podlaha are with the Department of Ecology and Evolutionary Biology, Yale University, New Haven, Connecticut, United States of America.


“If we take modularity at all seriously, then any attempt to use developmental mechanisms as phylogenetic tools is doomed: how could one hope to distinguish between bona fide conservation (a stable history between mechanism character) and re-use or (worse yet) re-invention?”—von Dassow and Munro, 1999 [1]

Throughout their evolutionary history, organisms have evolved numerous complex morphological, physiological, and behavioral adaptations to increase their chances of survival and reproduction. Insects have evolved wings and flight, which allowed them to better disperse [2], beetles have grown horns to fight over females [3], and moths and butterflies have decorated their wings with bright circles of colored scales to scare off predators [4]. The way that most of these and other adaptations first evolved, however, is still largely unknown. In the last two decades we have learned that novel traits appear to be built using old genes wired in novel ways [5], but it is still a mystery whether these novel traits evolve when genes are rewired de novo, one at a time, into new developmental networks, or whether clusters of pre-wired genes are co-opted into the development of the new trait. The speed of evolution of novel complex traits is likely to depend greatly on which of these two mechanisms underlies their origin. It is important, thus, to understand how novel complex traits evolve.

So far, our understanding of how adaptations and novel morphological traits are acquired is mostly founded on single gene case studies. On the one hand, researchers have focused on changes to morphology that involve regulatory or structural mutations in enzyme-coding loci predominantly at the termini of regulatory circuits (see reviews in [6,7]), and, on the other hand, researchers have dissected the genetic and/or developmental changes that underlie the modification or disappearance of pre-existent complex traits (Table 1). Few studies, however, have tried to directly address the genetic and developmental origins of new complex traits.

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Ancestral humano mais antigo do que antes 'imaginado'

Human Ancestor Older Than Previously Thought; Finding Offers New Insights Into Evolution

ScienceDaily (June 30, 2011) — Modern humans never co-existed with Homo erectus -- a finding counter to previous hypotheses of human evolution -- new excavations in Indonesia and dating analyses show. The research, reported in the journal PLoS ONE, offers new insights into the nature of human evolution, suggesting a different role for Homo erectus than had been previously thought.




Generalized composite sedimentary geology of the Ngandong and Jigar “20 meter terrace" denoting stratigraphic positions of Homo erectus fossil material and dated pumices. (Credit: Etty Indriati, Carl C. Swisher, Christopher Lepre, Rhonda L. Quinn, Rusyad A. Suriyanto, Agus T. Hascaryo, Rainer Grün, Craig S. Feibel, Briana L. Pobiner, Maxime Aubert, Wendy Lees, Susan C. Antón. The Age of the 20 Meter Solo River Terrace, Java, Indonesia and the Survival of Homo erectus in Asia. PLoS ONE, 2011; 6 (6): e21562 DOI: 10.1371/journal.pone.0021562)

The work was conducted by the Solo River Terrace (SoRT) Project, an international group of scientists directed by anthropologists Etty Indriati of Gadjah Mada University in Indonesia and Susan Antón of New York University.

Homo erectus is widely considered a direct human ancestor -- it resembles modern humans in many respects, except for its smaller brain and differently shaped skull -- and was the first of our ancestors to migrate out of Africa, approximately 1.8 million years ago. Homo erectus went extinct in Africa and much of Asia by about 500,000 years ago, but appeared to have survived in Indonesia until about 35,000 to 50,000 years ago at the site of Ngandong on the Solo River. These late members of Homo erectus would have shared the environment with early members of our own species, Homo sapiens, who arrived in Indonesia by about 40,000 years ago.

The existence of the two species simultaneously has important implications for models about the origins of modern humans. One of the models, the Out of Africa or replacement model, predicts such overlap. However, another, the multiregional model, which posits that modern humans originated as a result of genetic contributions from hominin populations all around the Old World (Africa, Asia, Europe), does not. The late survival of Homo erectus in Indonesia has been used as one line of support for the Out of Africa model.

However, findings by the SoRT Project show that Homo erectus' time in the region ended before modern humans arrived there. The analyses suggest that Homo erectus was gone by at least 143,000 years ago -- and likely by more than 550,000 years ago. This means the demise of Homo erectus occurred long before the arrival of Homo sapiens.

"Thus, Homo erectus probably did not share habitats with modern humans," said Indriati.

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The Age of the 20 Meter Solo River Terrace, Java, Indonesia and the Survival of Homo erectus in Asia

Etty Indriati1, Carl C. Swisher III2*, Christopher Lepre2,3,Rhonda L. Quinn2,4, Rusyad A. Suriyanto1, Agus T. Hascaryo1, Rainer Grün5, Craig S. Feibel2, Briana L. Pobiner6, Maxime Aubert5, Wendy Lees5, Susan C. Antón7*

1 Laboratory of Bio and Paleoanthropology, Faculty of Medicine, Gadjah Mada University, Yogyakarta, Indonesia, 2 Department of Earth and Planetary Sciences, Rutgers University, Piscataway, New Jersey, United States of America, 3 Lamont Doherty Earth Observatory Palisades, Columbia University, New York, New York, United States of America, 4 Department of Anthropology, Loyola University of Chicago, Chicago, Illinois, United States of America, 5 Research School of Earth Sciences, The Australian National University, Canberra, Australia, 6 Human Origins Program, National Museum of Natural History, Smithsonian Institution, Washington, D. C., United States of America, 7 Center for the Study of Human Origins, Department of Anthropology, New York University, New York, New York, United States of America

Abstract 

Homo erectus was the first human lineage to disperse widely throughout the Old World, the only hominin in Asia through much of the Pleistocene, and was likely ancestral to H. sapiens. The demise of this taxon remains obscure because of uncertainties regarding the geological age of its youngest populations. In 1996, some of us co-published electron spin resonance (ESR) and uranium series (U-series) results indicating an age as young as 35–50 ka for the late H. erectussites of Ngandong and Sambungmacan and the faunal site of Jigar (Indonesia). If correct, these ages favor an African origin for recent humans who would overlap with H. erectus in time and space. Here, we report 40Ar/39Ar incremental heating analyses and new ESR/U-series age estimates from the “20 m terrace" at Ngandong and Jigar. Both data sets are internally consistent and provide no evidence for reworking, yet they are inconsistent with one another. The 40Ar/39Ar analyses give an average age of 546±12 ka (sd±5 se) for both sites, the first reliable radiometric indications of a middle Pleistocene component for the terrace. Given the technical accuracy and consistency of the analyses, the argon ages represent either the actual age or the maximum age for the terrace and are significantly older than previous estimates. Most of the ESR/U-series results are older as well, but the oldest that meets all modeling criteria is 143 ka+20/−17. Most samples indicated leaching of uranium and likely represent either the actual or the minimum age of the terrace. Given known sources of error, the U-series results could be consistent with a middle Pleistocene age. However, the ESR and 40Ar/39Ar ages preclude one another. Regardless, the age of the sites and hominins is at least bracketed between these estimates and is older than currently accepted.

Citation: Indriati E, Swisher CC III, Lepre C, Quinn RL, Suriyanto RA, et al. (2011) The Age of the 20 Meter Solo River Terrace, Java, Indonesia and the Survival of Homo erectus in Asia. PLoS ONE 6(6): e21562. doi:10.1371/journal.pone.0021562

Editor: Fred H. Smith, Illinois State University, United States of America

Received: January 17, 2011; Accepted: June 3, 2011; Published: June 29, 2011

Copyright: © 2011 Indriati et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Funding: The project was funded by the U.S. NSF BCS 0317292 to SCA, an AAAS WISC program grant to EI and SCA, and a UGM sabbatical grant to EI. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.

Competing interests: The authors have declared that no competing interests exist.


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John Lennon 'falou e disse': Darwin é simplesmente um monte de lixo irracional

Que contrasenso para um militante marxista como eu na década de 1960s ser fã do rock-'n-roll e especialmente da música dos Beatles. Os companheiros comunistas da época diziam que era um pecado da burguesia e que eu seria 'reeducado', e reabilitado após me retratar fazendo 'confissão pública' desse pecado burguês.

Estamos em 2011, mas não sabia que John Lennon era um cético de carteirinha sobre as especulações transformistas de Darwin. Numa entrevista concedida à revista Playboy, uma revista acima de qualquer suspeita nesta questão, o ídolo revelou ter, na verdade, mais do que dúvidas. Ele rachou de rir daquilo que considerou sendo a coisa mais ridícula da teoria de Darwin, comparando-a, PASMEM Nomenklatura científica, Grande Mídia e Galera dos meninos e meninas de Darwin, comparando a teoria da evolução de Darwin com o CRIACIONISMO DA TERRA JOVEM.

Como nós sabemos disso? Foi numa entrevista que ele deu à revista Playboy, uma das últimas concedidas e agora reimpressa em um livro pelo jornalista
 David Sheff, All We Are Saying: The Last Major Interview with John Lennon and Yoko Ono (St. Martin's Griffin, 2000):

"Nem eu penso que nós viemos do macaco, a propósito... Isso é outro monte de lixo. Que diabo isso é baseado? Nós não poderíamos ter vindo de qualquer coisa --peixe, talvez, mas não macacos. Eu não creio na evolução de peixe para macaco até o homem. Por que os macacos não estão se transformando em homens agora? É simplesmente lixo. É simplesmente lixo irracional, tão maluco quanto aqueles que crêem que o mundo foi feito apenas há quatro mil anos atrás, os fundamentalistas. Isso e a estória do macaco são as duas insanas, assim como o macaco ficando eretos subitamente. Os homens primitivos são sempre desenhados como macacos, certo? Porque isso se encaixa com a teoria com que nós temos vivido desde o tempo de Darwin. Eu não aceito essa negócio de macacos. [Cantarolando] "Too much monkey business..." [Rindo] Eu não aceito. Eu não tenho nenhuma base para ela e nenhuma teoria a oferecer, eu simplesmente não aceito. Alguma coisa diferente disso. Alguma coisa mais simples. Eu não aceito nada a não ser "Sempre foi e sempre será." Eu não posso imaginar nada mais ou menos. As outras teorias mudam todo o tempo. Eles erguem esses ídolos, e depois os derrubam. Isso deixa os antigos professores felizes na universidade. Dá a eles alguma coisa a fazer. Eu não sei se há algum mal nisso, a não ser que eles enfiam isso goela abaixo nas gargantas de todos. Tudo o que eles me disseram quando eu era menino já foi invalidado pelo mesmo tipo de "especialistas" que elaboraram isso antes. Pronto."

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"Nor do I think we came from monkeys, by the way... That's another piece of garbage. What the hell's it based on? We couldn't've come from anything--fish, maybe, but not monkeys. I don't believe in the evolution of fish to monkeys to men. Why aren't monkeys changing into men now? It's absolute garbage. It's absolutely irrational garbage, as mad as the ones who believe the world was made only four thousand years ago, the fundamentalists. That and the monkey thing are both as insane as the apes standing up suddenly. The early men are always drawn like apes, right? Because that fits in the theory we have been living with since Darwin. I don't buy that monkey business. [Singing] "Too much monkey business..." [Laughing] I don't buy it. I've got no basis for it and no theory to offer, I just don't buy it. Something other than that. Something simpler. I don't buy anything other than "It always was and ever shall be." I can't conceive of anything less or more. The other theories change all the time. They set up these idols and then they knock them down. It keeps all the old professors happy in the university. It gives them something to do. I don't know if there's any harm in it except they ram it down everybody's throat. Everything they told me as a kid has already been disproved by the same type of "experts" who made them up in the first place. There."


NOTA DESTE BLOGGER:

Meu ídolo do rock detonando Darwin, o meu ídolo científico. Que tempos nós vivemos! Uma notícia dessas merece manchete na primeira página da Folha de São Paulo, Estadão, e capa da VEJA, Galileu, SuperInteressante. Estou sonhando muito alto, pois esta mídia que está aí é uma mídia que beija-mão e beija-pé de Darwin, e há mais de uma década nada pública sobre as dificuldades fundamentais da teoria da evolução de Darwin através da seleção natural no contexto de justificação teórica [Argh, falar neste contexto é como como assassinar Darwin em todos os multiversos imaginados pelo Marcelo Gleiser].

Fui, pensando, nem sei por que, que Darwin [agnóstico - um ateu que não saiu do armário] deve estar cantando no seu confortável túmulo na Abadia de Westminster perto de Newton [um cientista teísta] - I need somebody, not just anybody, please...

Que venha a nova teoria geral da evolução - a SÍNTESE EVOLUTIVA AMPLIADA!!! que, ao tudo indica, pela montanha de evidências negativas, não pode e nem será selecionista e vai incorporar aspectos lamarckistas. Estão rindo do que? Darwin foi muito mais lamarckista do Lamarck na sexta edição do Origem das Espécies. Eu sei do que estou falando... e os historiadores darwinistas honestos também...