The meaning of biological information
Eugene V. Koonin
Published 8 February 2016. DOI: 10.1098/rsta.2015.0065
Abstract
Biological information encoded in genomes is fundamentally different from and effectively orthogonal to Shannon entropy. The biologically relevant concept of information has to do with ‘meaning’, i.e. encoding various biological functions with various degree of evolutionary conservation. Apart from direct experimentation, the meaning, or biological information content, can be extracted and quantified from alignments of homologous nucleotide or amino acid sequences but generally not from a single sequence, using appropriately modified information theoretical formulae. For short, information encoded in genomes is defined vertically but not horizontally. Informally but substantially, biological information density seems to be equivalent to ‘meaning’ of genomic sequences that spans the entire range from sharply defined, universal meaning to effective meaninglessness. Large fractions of genomes, up to 90% in some plants, belong within the domain of fuzzy meaning. The sequences with fuzzy meaning can be recruited for various functions, with the meaning subsequently fixed, and also could perform generic functional roles that do not require sequence conservation. Biological meaning is continuously transferred between the genomes of selfish elements and hosts in the process of their coevolution. Thus, in order to adequately describe genome function and evolution, the concepts of information theory have to be adapted to incorporate the notion of meaning that is central to biology.
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NOTA DESTE BLOGGER:
A teoria do Design Inteligente é uma teoria de informação desde sua incipiência, e rejeitada veementemente pela comunidade científica. E a agora esta comunidade científica está se rendendo às evidências de que a biologia dos séculos 20 e 21 é uma ciência de informação?
E é a turma do Design Inteligente que impede o avanço da ciência???
Por que afirmamos aqui ser a nova teoria geral da evolução - a Síntese Evolutiva Ampliada/Estendida, lançada em agosto de 2015, uma teoria científica natimorta? É porque ela timidamente aborda a questão da informação complexa especificada.
O bom em ciência é que são as evidências que estabelecem o fato científico e não as teorias.
Charbel Niño El-Hani, meu amigo, lembra que em 2006, após minha palestra sobre Design Inteligente, na Universidade Presbiteriana Mackenzie, em São Paulo, você disse que eu tinha embarcado na canoa furada do Design Inteligente? Lembra de minha resposta? Eu respondi: Charbel, eu estou apostando todas as minhas fichas no cavalo do DI do que apostar no pangaré do Darwin?
Parece que eu estou ganhando a aposta, Charbel...
O bom em ciência é que são as evidências que estabelecem o fato científico e não as teorias.
Charbel Niño El-Hani, meu amigo, lembra que em 2006, após minha palestra sobre Design Inteligente, na Universidade Presbiteriana Mackenzie, em São Paulo, você disse que eu tinha embarcado na canoa furada do Design Inteligente? Lembra de minha resposta? Eu respondi: Charbel, eu estou apostando todas as minhas fichas no cavalo do DI do que apostar no pangaré do Darwin?
Parece que eu estou ganhando a aposta, Charbel...
