Rak tefilah esah - Avraham Fried
domingo, novembro 28, 2010
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Para Wendy Goldman Rohm, minha boa amiga e escritora judia.
Para, por e com Israel, sempre!
A torre das especulações transformistas de Darwin diante das evidências científicas do século 21
Este é o atual status epistêmico das especulações transformistas de Darwin diante das evidências (contexto de justificação teórica) encontradas em diversas áreas científicas do século 21.
Chamam o fato, Fato, FATO da teoria da evolução através da seleção natural como sendo o alicerce da biologia evolucionária: nada em biologia faz sentido a não ser à luz da evolução (Theodosius Dobzhansky).
Contrariando o mantra dobzhanskyano: nada em biologia faz sentido a não ser à luz das evidências, e aonde elas nos levarem. Dizem as más línguas que Dobzhansky, ao ser alertado por um dos seus alunos da USP, de que as evidências encontradas nas pesquisas genéticas com Drosophila melanogaster contrariavam a teoria da evolução, teria dito:
"Evidências? Que se danem as evidências, o que vale é a teoria".
Quem pode confirmar isso se recusa fazê-lo...
Que venga la nueva teoría de evolución - a SÍNTESE EVOLUTIVA AMPLIADA que, por essas e outras, NÃO PODE E NEM DEVE SER SELECIONISTA.
Quem viver, verá!!!
Darwin errou e Patrick Matthew propôs uma teoria de evolução gradualista mais exata
Scottish Horticulturalist Patrick Matthew Proposed More Accurate Theory of Gradual Evolution Before Charles Darwin Did, Geologist Argues
ScienceDaily (Nov. 9, 2010) — Charles Darwin may not have put forth the earliest or most accurate theory of gradual evolution. In an essay in the journalHistorical Biology, New York University geologist Michael Rampino argues that a more accurate theory of gradual evolution, positing that long periods of evolutionary stability are disrupted by catastrophic mass extinctions of life, was put forth by Scottish horticulturalist Patrick Matthew prior to Darwin's published work on the topic.
"Matthew discovered and clearly stated the idea of natural selection, applied it to the origin of species, and placed it in the context of a geologic record marked by catastrophic mass extinctions followed by relatively rapid adaptations," says Rampino, whose research on catastrophic events includes studies on volcano eruptions and asteroid impacts. "In light of the recent acceptance of the importance of catastrophic mass extinctions in the history of life, it may be time to reconsider the evolutionary views of Patrick Matthew as much more in line with present ideas regarding biological evolution than the Darwin view."
Matthew (1790-1874), Rampino notes, published a statement of the law of natural selection in a little-read Appendix to his 1831 book Naval Timber and Arboriculture. Even though both Darwin and his colleague Alfred Russel Wallace acknowledged that Matthew was the first to put forth the theory of natural selection, historians have attributed the unveiling of the theory to Darwin and Wallace. Darwin's notebooks show that he arrived at the idea in 1838, and he composed an essay on natural selection as early as 1842 -- years after Matthew's work appeared. Darwin and Wallace's theory was formally presented in 1858 at a science society meeting in London. Darwin's Origin of Species appeared a year later.
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Read more here/Leia mais aqui: Science Daily
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Historical Biology
Darwin's error? Patrick Matthew and the catastrophic nature of the geologic record
Author: Michael R. Rampino a
Abstract
In 1831, the Scottish horticulturalist Patrick Matthew (1790-1874) published a clear statement of the law [sic] of natural selection in an Appendix to his book Naval Timber and Arboriculture, which both Darwin and Wallace later acknowledged. Matthew, however, was a catastrophist, and he presented natural selection within the contemporary view that relatively long intervals of environmental stability were episodically punctuated by catastrophic mass extinctions of life. Modern studies support a similar picture of the division of geologic time into long periods of relative evolutionary stability ended by sudden extinction events. Mass extinctions are followed by recovery intervals during which surviving taxa radiate into vacated niches. This modern punctuated view of evolution and speciation is much more in line with Matthew's episodic catastrophism than the classical Lyellian-Darwinian gradualist view.
Keywords: natural selection; catastrophism; Charles Darwin; Patrick Matthew
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Professores, pesquisadores e alunos de universidades públicas e privadas com acesso ao site CAPES/Periódicos podem ler gratuitamente este artigo da Historical Biology e de mais 22.440 publicações científicas.
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NOTA CAUSTICANTE DESTE BLOGGER:
Darwin sabia, NOTA BENE, sabia, e a comunidade científica da época, NOTA BENE, sabia, e a comunidade científica do século 21 sabe, NOTA BENE, sabe que o registro geológico (contexto de justificação teórica) NÃO CORROBORA as especulações transformistas de Darwin desde 1859.
NOTA BENE: DESDE 1859 que Darwin não fecha as contas epistëmicas no contexto de justificação teórica. E esta é a maior ideia que toda a humanidade já teve? Ora, vão caçar sapos de botas na lagoa de Down. E esta a ideia que revolucionou a biologia? Como é que toda a uma comunidade científica se deixou convencer por hipóteses que não são corroboradas pelas evidências é que me deixa pasmo. Ou eles são extremamente burros, oops ignorantes, mesmo sendo cientistas, ou há alguma outra coisa por detrás deste convencimento: uma agenda ideológica naturalista tentando se passar por ciência.
Fui, nem sei por que, pensando: quando é que a Akademia vai se convencer de que tem em mãos um mito secularista de criação em vez de teoria científica que explique a origem e evolução das espécies?
Eu disse mito? Disse, mas muito antes de mim, muito antes de mim, Sören Lovtrup, um biólogo evolucionista, chamou o darwinismo de MITO!!!
As mutações são realmente aleatórias???
Even small SNP clusters are non-randomly distributed: is this evidence of mutational non-independence?
William Amos*
+Author Affiliations
Department of Zoology, Cambridge University, Downing Street, Cambridge CB2 3EJ, UK
*w.amos@zoo.cam.ac.uk
Abstract
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are distributed highly non-randomly in the human genome through a variety of processes from ascertainment biases (i.e. the preferential development of SNPs around interesting genes) to the action of mutation hotspots and natural selection. However, with more systematic SNP development, one might expect an increasing proportion of SNPs to be distributed more or less randomly. Here, I test this null hypothesis using stochastic simulations and compare this output with that of an alternative hypothesis that mutations are more likely to occur near existing SNPs, a possibility suggested both by molecular studies of meiotic mismatch repair in yeast and by data showing that SNPs cluster around heterozygous deletions. A purely Poisson process generates SNP clusters that differ from equivalent data from human chromosome 1 in both the frequency of different-sized clusters and the SNP density within each cluster, even for small clusters of just four or five SNPs, while clusters on the X chromosome differ from those on the autosomes. In contrast, modest levels of mutational non-independence generate a reasonable fit to the real data for both cluster frequency and density, and also exhibit the evolutionary transience noted for ‘mutation hotspots’. Mutational non-independence therefore provides an interesting new hypothesis that appears capable of explaining the distribution of SNPs in the human genome.
mutation hotspot, heterozygote instability, SNP clusters, mismatch repair, human
Footnotes
Received September 29, 2009.
Accepted December 15, 2010.
© 2010 The Royal Society
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Ganhando melhor entendimento sobre a divisão celular
Press Release 10-223
Molecular "machine" responsible for pulling chromosome copies apart is isolated and seen in action outside the cell
During cell division, the kinetochore and microtubule pull chromosome copies away from each other.
November 24, 2010
The dance of cell division is carefully choreographed and has little room for error. Paired genetic information is lined up in the middle of the cell in the form of chromosomes. The chromosomes must then be carefully pulled apart so that the resulting daughter cells each have an identical copy of the mother cell's DNA.
The molecular machinery that shepherds and literally pulls the chromosomes apart consists of paired microtubules radiating from opposite poles of the dividing cell and an enormous, but precise, molecular complex called a kinetochore. This 'gentle giant' grabs onto a single special locus on the chromosome known as the centromere.
Paradoxically, the more tension on the microtubule, the tighter the grip of the kinetochore--analogous to the clever mechanism of a Chinese finger trap that grips a finger tighter, the more you try to pull it off. In fact, the proper amount of tension may be a clue to the cell that all is proceeding according to plan. In the absence of tension, the cell is alerted to damage or mutation such as cancer and will frequently self-destruct.
In another feat of molecular acrobatics and precision, as the microtubule draws the captured chromosome towards the pole, it is actually shortening by losing tubulin subunits. To make things a little more complicated, it is disassembling at the very point where the kintechore attaches. In other words: imagine pulling yourself up on a rope, but as you progress upwards, the end of the rope is disappearing right from under where you were last gripping it. This is what this deft mechanism is accomplishing. Because the kinetochore has many points of contact (like a sleeve, or like that very same Chinese handcuff) it is good at not letting go of the microtubule even as it disassembles away.
At 100 nanometers across, the kinetochore is a true behemoth. One of the most complicated functional molecules in the cell is a ribosome, but that only measures 25 nanometers across by comparison.
This perspective of molecular size and complexity should highlight what a true achievement it is that Bungo Akiyoshi (of the Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle) and colleagues are reporting isolating the kinetochore outside of the cell and having it perform the same tasks in vitro that it is seen to undertake in vivo. They report their findings in the November 25 issue of Nature. The research was, in part, supported by a grant from the National Science Foundation.
Sue Biggins, who participated in the research, says "Purifying this molecule out of the cell is as exciting today, as seeing the ribosome was back over 50 years ago!"
-NSF-
Dean Forbes, Fred Hutchinson Cancer Research Center 206-605-0311 dforbes@fhcrc.org
Principal InvestigatorsSue Biggins, Fred Hutchinson Cancer Research Center 206 667 5766 sbiggins@fhcrc.org
The National Science Foundation (NSF) is an independent federal agency that supports fundamental research and education across all fields of science and engineering. In fiscal year (FY) 2010, its budget is about $6.9 billion. NSF funds reach all 50 states through grants to nearly 2,000 universities and institutions. Each year, NSF receives over 45,000 competitive requests for funding, and makes over 11,500 new funding awards. NSF also awards over $400 million in professional and service contracts yearly.
Sede do Geopark Araripe será inaugurada em dezembro
Projeto do Geopark poderá contemplar novas áreas de pesquisa, a fim de ampliar seu acervo na região do Cariri
O momento é de expectativa em relação à avaliação do projeto Geopark Araripe. A amplitude dos debates e maior divulgação aconteceu durante a 1ª Conferência Latino-Americana e Caribenha de Geoparks [realizada entre 17 e 19 de novembro, no Ceará].
Nos próximos 20 dias, será inaugurada na região, com a provável presença do presidente Luiz Inácio Lula da Silva, a sede administrativa do Geopark Araripe, em Crato. Foram investidos no projeto, por meio do Ministério da Integração Nacional (MIN), cerca de R$ 800 mil em edificação, equipamentos e também transporte.
No último dia dos debates, ontem, foi ressaltada a importância de incorporar aos trabalhos áreas como a arqueologia da região, que hoje conta com um rico acervo em alguns municípios, onde já foram registrados importantes achados rupestres.
A Conferência de Geoparks, segundo o secretário de Ciência, Tecnologia e Educação Superior do Estado (Secitece), René Barreira, foi um passo importante no direcionamento futuro da criação de uma rede de geoparks no Brasil. Para isso, está acontecendo uma movimentação em nível ministerial.
Segundo o coordenador executivo do Geopark Araripe, Patrício Melo, um conjunto de ações foram planejadas de modo regular e emergencial para esse momento, mas sempre pautado numa avaliação para que fossem cumpridas metas que estavam planejadas até o ano de 2010.
Este ano, o projeto, que tem administração direta da Universidade Regional do Cariri (Urca), teve uma verba de manutenção de cerca de R$ 390 mil. "Isso significa que em outros aspectos fomos contemplados, no sentido de garantir que eventos com essa importância fossem realizados", diz ele.
Inventário
Patrício Melo destaca a importância do inventário que foi realizado nas áreas dos dez geossítios, em seis Municípios da região, e que agora estará sendo atualizado. A proposta de infraestrutura das áreas para visitação está em andamento, e os passos futuros são dar condições melhores aos geossítios para receber os visitantes. Ele ressalta o sentido diferenciado numa área em que as próprias comunidades devem ser os protagonistas do processo, por meio da promoção de um desenvolvimento sustentado nessas áreas e com promoção humana.
De acordo com o coordenador, a resposta tem sido positiva em relação a todos os procedimentos que foram avaliados até o momento. Os apoios dos governos do Estado e Federal e da própria Urca foram essenciais, conforme ele, dentro desse processo. "Agora teremos a possibilidade de planejar a médio e longo prazos. É um momento em que podemos respirar, porque esse processo de desenvolvimento de um geopark é difícil".
Fonte
Patrício Melo ressalta, dentro dessa condição, todas as desigualdades ainda existentes na região, ao considerar populações urbanas e rurais dentro de um processo diferenciado e Municípios com um nível maior de complexidade, em termos de serviços públicos.
O professor Álamo Feitosa Saraiva, do Comitê Científico do Geopark, afirma que esse é um momento de readequação e até de ampliação da unidade no Cariri, no sentido de possibilitar a inserção de áreas importantes da região, que ficaram de fora desse primeiro momento. Ele exemplifica áreas como a espeleologia, com as grutas do Município de Araripe, e as inscrições rupestres encontradas em vários municípios da região, como em Araripe.
"Estamos devendo à arqueologia. O nosso potencial é muito grande", diz ele, ao ressaltar a importância de se produzir um inventário dessas áreas.
No trabalho de escavação paleontológica, ele afirma que novos investimentos têm sido voltados para a pesquisa. Recentemente foram aprovados projetos do Instituto de Arqueologia e Paleontologia e Ambiente do Semi-Árido (Inapas), no valor de R$ 197 mil, e do CNPq, de R$ 126 mil, este específico para pesquisas específicas das formações Crato e Romualdo.
(Diário do Nordeste, 20/11)
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NOTA DESTE BLOGGER:
Tive o prazer de visitar o Geopark Araripe e realizar pesquisas devidamente autorizadas naquela região em agosto de 2007.
Fotos meramente ilustrativas para que mais brasileiros se interessem por conhecer e pesquisar neste lugar muito quente, mas maravilhoso demais.
Armadilha em Gaza: fundamentalismo islâmico e guerra de propaganda contra Israel
Um livro que desmistifica o trágico conflito no Oriente Médio e revela a existência de uma guerra de propaganda contra Israel
No mundo todo a mídia, mais preocupada em chocar do que em informar, associa a Israel a imagem de um estado militarista, que promove massacres de palestinos e se opõe a qualquer tentativa de paz na região. A aliança entre fundamentalistas islâmicos, pseudopacifistas e esquerdistas de vários matizes, unidos no ódio ao Estado de Israel, joga cortinas de fumaça sobre aspectos fundamentais da tragédia e propagandeia um suposto “genocídio” cometido pelos israelenses.
Descrever Gaza como “campo de concentração a céu aberto” virou clichê, mas é uma imagem totalmente distorcida. A realidade é muito mais complexa, e não se limita a uma mera disputa territorial entre palestinos e israelenses, e sim a um conflito ideológico, agravado pela ação de um grupo terrorista islâmico, o Hamas — satélite do Irã em Gaza —, que propaga explicitamente a luta pelo extermínio do Estado judaico, a única democracia do Oriente Médio. Israel já cedeu mais territórios aos palestinos do que os que ainda restam para ser devolvidos, e mesmo assim o conflito só se agravou. A Faixa de Gaza foi devolvida aos palestinos integralmente, os assentamentos foram retirados, mas ainda assim ela serve como plataforma de lançamento de foguetes palestinos contra as cidades israelenses próximas.
A guerra de propaganda anti-Israel impede uma visão equilibrada, fundamental para a paz na região. Um dos exemplos mais gritantes dessa campanha para deslegitimar o Estado judaico foi o episódio das seis embarcações que, em maio de 2010, tentaram furar o cerco à Faixa de Gaza e foram impedidas pelos israelenses, num confronto que deixou vários mortos e feridos. Este livro prova que, longe de levar ajuda humanitária a Gaza, como seus organizadores muçulmanos alegaram, a chamada “Flotilha da Paz” nada mais foi que uma inteligente operação midiática com o objetivo de isolar Israel da comunidade internacional, fragilizá-lo politicamente e obter concessões políticas, ou seja, uma verdadeira armadilha.
Desafiando análises superficiais sobre o tema, o cientista político Jorge Zaverucha traça de modo conciso e informativo um resumo da história dos enfrentamentos entre árabes e israelenses, desde as primeiras migrações judaicas no século XIX para a Palestina otomana, até as sucessivas guerras que sacudiram o Estado de Israel pouco após a sua fundação, em 1948, oferecendo-nos a oportunidade valiosa de enxergar o trágico conflito do Oriente Médio a partir de uma perspectiva que foge de clichês e lugares-comuns, descortinando cenários fundamentais para a compreensão das dificuldades em se atingir a paz na Terra Santa.
Armadilha em Gaza tem ainda o mérito de revelar dados surpreendentes, como o relatório da ONU com o índice sócio-econômico dos territórios palestinos, superior, por exemplo, ao da média do mundo árabe. Algo, portanto, totalmente oposto ao torpe mito do “campo de concentração a céu aberto”...
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Para, por e com Israel, sempre!
Descoberta a cura do homossexualismo: uma palmada!
Palmada muda filho "gayzinho", declara deputado federal
DE SÃO PAULO - O deputado federal reeleito Jair Bolsonaro (PP-RJ) disse que pais precisam agredir um filho homossexual para mudar seu comportamento.
A "receita" foi dada no programa "Participação Popular", na TV Câmara, que discutiu a "Lei da Palmada" -projeto de lei que proíbe punição corporal às crianças.
"Se o filho começa a ficar assim, meio gayzinho, [ele] leva um couro e muda o comportamento dele", afirmou.
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Texto completo para assinantes da Folha de São Paulo ou UOL.
NOTA DESTE BLOGGER: Este blogger não é homófobo, mas é visceralmente contra o PL-122 como está redigido, e será um dos primeiros a desobedecê-lo, sabendo de antemão no que isso pode implicar: CADEIA!!!
DESOBEDIÊNCIA CIVIL JÁ, POIS EXISTIR É RESISTIR!!!
NOTA DESTE BLOGGER: Este blogger não é homófobo, mas é visceralmente contra o PL-122 como está redigido, e será um dos primeiros a desobedecê-lo, sabendo de antemão no que isso pode implicar: CADEIA!!!
DESOBEDIÊNCIA CIVIL JÁ, POIS EXISTIR É RESISTIR!!!
Nomenklatura científica parabeniza este blogger: 360.000 visitantes no mundo inteiro!
Source/Fonte: ClustrMaps
A Nomenklatura científica, de modo inusitado, parabenizou este blogger por esta marca atingida: 360.000 visitantes nos cinco continentes!
Seria bom demais se fosse verdade, mas a verdade pristina e que incomoda muito a Nomenklatura científica, e deixa a Galera dos meninos e meninas de Darwin com urticária generalizada, é que este blog está ganhando dimensões nunca imaginadas por este blogger: atingir o mundo todo abordando questões que, se não totalmente proibidas, dificilmente são abordadas nas universidades -- um espaço para se discutir livremente ideias.
Fui, feliz da vida, nem sei por que pensando que 360.000 visitantes são 4.5 estádios do Maracanã lotados (80.000) gritando:
Desafiando a Nomenklatura científica! Desafiando a Nomenklatura científica! Desafiando a Nomenklatura científica!
Darwin, cadê você, não adianta se esconder, o Design Inteligente vai comer você!. Darwin, cadê você, não adianta se esconder, o Design Inteligente vai comer você! Darwin, cadê você, não adianta se esconder, o Design Inteligente vai comer você!
U, tereré. U, tereré. U, tereré. Design inteligente!!!
Desafiando a Nomenklatura científica! Desafiando a Nomenklatura científica! Desafiando a Nomenklatura científica!
Darwin, cadê você, não adianta se esconder, o Design Inteligente vai comer você!. Darwin, cadê você, não adianta se esconder, o Design Inteligente vai comer você! Darwin, cadê você, não adianta se esconder, o Design Inteligente vai comer você!
U, tereré. U, tereré. U, tereré. Design inteligente!!!
Unicamp testará novo sistema de avaliação
26/11/2010
Agência FAPESP – A Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) fará parte de um projeto piloto para usar o Student Experience in the Research University (SERU), sistema de avaliação usado por universidades públicas nos Estados Unidos.
Segundo a Unicamp, com base em informações fornecidas pelos próprios estudantes sobre suas experiências nas instituições de pesquisa, o sistema permitirá que a partir de minucioso questionário se desenvolvam estudos de avaliação de desempenho dos alunos no ensino superior público.
Universidade fará parte de projeto piloto para usar o Student Experience in the Research University, utilizado por universidades públicas norte-americanas
O convite para participar da versão brasileira do projeto veio do fundador e coordenador do SERU, John Douglass, pesquisador sênior do Center for Studies in Higher Education da Universidade da Califórnia em Berkeley, que é pesquisador visitante do Grupo de Estudos em Ensino Superior (GEES) do Centro de Estudos Avançados (CEAv) da Unicamp.
De acordo com Renato Hyuda de Luna Pedrosa, coordenador do GEES, o projeto será adaptado, uma vez que o questionário traz blocos mais especializados e outros dedicados a aspectos do sistema norte-americano de ensino superior.
“Nossa versão do questionário será disponibilizada on-line para a entrada de dados pelos alunos. Coletadas as informações, vamos fazer a conexão com o banco de dados acadêmicos da Unicamp”, disse.
A ideia é que outras universidades brasileiras se juntem ao projeto piloto que será centralizado na Unicamp.
Uma pitada de tempero da vida: variação também é boa para as lebres
Spice of Life: Variety Is Also Good for Hares
ScienceDaily (Nov. 25, 2010) — Since 1871, when Charles Darwin wrote The Descent of Man, it has been widely accepted that "Variability is the necessary basis for the action of selection." Variability is associated with the ability to adapt, which is clearly beneficial at a species level. But there is increasing evidence that genetic variability may also give rise to advantages at the level of the individual. Steve Smith and Franz Suchentrunk at the Research Institute of Wildlife Ecology, University of Veterinary Medicine, Vienna have now shown that variation at a particular gene locus in hares is associated with greater reproductive success.
Young hare. (Credit: Vetmeduni Vienna/Teresa Valencak)
The results are published in the October issue of the journal Molecular Ecology.
One of the key questions of evolutionary biology is how variation at the level of single genes affects animals' ability to produce young. Together with collaborators in the UK and in Belgium, Steve Smith and Franz Suchentrunk at the Research Institute of Wildlife Ecology, University of Veterinary Medicine, Vienna have designed a mathematical model to describe the effects of genetic variation on the reproductive success of the European hare. They tested the model on data obtained from wild hares in Belgium and in eastern Austria.
Smith and colleagues elected to examine the influence of two different sites in the major histocompatability complex (MHC). The MHC is involved in immune reactions and MHC genes have recently received a great deal of attention as representing a possible link between genetic variation and fitness. A number of studies have implicated them as possible causes of reproductive failure in humans but to date no experiments have attempted to assess whether MHC genes are associated with fitness in populations of wild animals.
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Read more here/Leia mais aqui: Science Daily
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Molecular Ecology
Volume 19, Issue 19, pages 4131–4143, October 2010
Homozygosity at a class II MHC locus depresses female reproductive ability in European brown hares
STEVE SMITH1, THOMAS MANG1,2, JOELLE GOÜY DE BELLOCQ1,3, HELMUT SCHASCHL4, CLAUDIA ZEITLHOFER5, KLAUS HACKLÄNDER5, FRANZ SUCHENTRUNK1
Article first published online: 20 AUG 2010
DOI: 10.1111/j.1365-294X.2010.04765.x
Keywords: Bayesian analysis; DQA; DRB; Lepus europaeus; MHC variation; reproductive success; zero-inflated Poisson regression model
Abstract
The link between adaptive genetic variation, individual fitness and wildlife population dynamics is fundamental to the study of ecology and evolutionary biology. In this study, a Bayesian modelling approach was employed to examine whether individual variability at two major histocompatibility complex (MHC) class II loci (DQA and DRB) and eight neutral microsatellite loci explained variation in female reproductive success for wild populations of European brown hare (Lepus europaeus). We examined two aspects of reproduction: the ability to reproduce (sterility) and the number of offspring produced (fecundity). Samples were collected from eastern Austria, experiencing a sub-continental climatic regime, and from Belgium with a more Atlantic-influenced climate. As expected, reproductive success (both sterility and fecundity) was significantly influenced by age regardless of sampling locality. For Belgium, there was also a significant effect of DQA heterozygosity in determining whether females were able to reproduce (95% highest posterior density interval of the regression parameter [−3.64, −0.52]), but no corresponding effect was found for Austria. In neither region was reproduction significantly associated with heterozygosity at the DRB locus. DQA heterozygotes from both regions also showed a clear tendency, but not significantly so, to produce a larger number of offspring. Predictive simulations showed that, in Belgium, sub-populations of homozygotes will have higher rates of sterile individuals and lower average offspring numbers than heterozygotes. No similar effect is predicted for Austria. The mechanism for the spatial MHC effect is likely to be connected to mate choice for increased heterozygosity or to the linkage of certain MHC alleles with lethal recessives at other loci.
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Biodiversidade norte-americana vigiada
26/11/2010
Por Elton Alisson
Agência FAPESP – Os Estados Unidos devem iniciar em 2011 a montagem de uma das maiores redes de observatórios ecológicos do mundo. Trata-se da National Ecological Observatory Network (Neon), que tem como objetivo reunir dados de experimentos e de observações ecológicas e climáticas feitas em todo o país.
Será a primeira rede do tipo projetada especialmente para identificar e prever mudanças ecológicas em uma escala de décadas. Com custo estimado de US$ 433 milhões, financiados pela National Science Foundation (NSF), a rede terá participação de diversas outras agências e instituições e está em fase final de planejamento.
Estados Unidos montarão uma das maiores redes de observatórios ecológicos do mundo, diz pesquisador (Neon)
“O presidente Barack Obama solicitou a inclusão da Neon no orçamento do país para 2011 e a NSF já autorizou a concessão da verba para o projeto. Só estamos esperando ela ser aprovada no Congresso para iniciar a construção, que deve levar cinco anos”, disse Michael Keller, ex-cientista-chefe da rede, à Agência FAPESP.
Keller, que participou da fase de desenho do projeto e teve que se desligar dele há cerca de um mês para assumir um novo posto no Serviço Florestal do Departamento de Agricultura dos Estados Unidos, esteve no International Workshop on Long-Term Studies on Biodiversity, promovido pelo programa Biota-FAPESP no dia 23 de novembro.
“A ideia do projeto é reunir informações que costumam estar muito dispersas e ter extensão espacial limitada, disponibilizando-as o mais rapidamente possível e da melhor forma aos pesquisadores para que eles possam testar seus modelos”, disse o cientista que foi pesquisador visitante na Universidade de São Paulo e integrou o Programa da Grande Esfera-Atmosfera da Amazônia (LBA).
As informações integradas pelo sistema de monitoramento serão disponibilizadas em um site na internet no qual poderão ser acessadas gratuitamente por cientistas de qualquer país.
“Os dados de longo prazo e em escala continental, coletados e fornecidos pela Neon, possibilitarão compreender melhor e fazer previsões em grande escala dos impactos das mudanças climáticas, do uso do solo e da ação de espécies invasivas na biodiversidade”, apontou.
Keller explicou que, para realizar a coleta de dados que abastecerão a Neon, o território dos Estados Unidos foi dividido por meio de uma técnica multigeográfica em 20 partes, batizadas de “domínios ecoclimáticos”.
Nesses locais, que representam diferentes tipos de vegetação, geografia, clima e ecossistemas, serão coletadas informações referentes a mais de 500 variáveis definidas pelos cientistas da rede, entre as quais temperatura, pluviometria e diversidade de organismos.
“Em função das restrições orçamentárias do projeto, teremos que medir um grande número de variáveis em poucos lugares. A rede Neon não é um programa de monitoramento tradicional que tem diversas instâncias espaciais”, disse.
Dados abertos
A coleta de dados representará o maior trabalho a ser feito pela rede de observatórios ecológicos. Reunidos, eles formarão um conjunto de 130 mil amostras, entre organismos individuais, partes deles ou tecidos.
As informações serão coletadas por meio de 20 estações de observação fixas e 40 realocáveis, distribuídas pelos 20 domínios ecoclimáticos do país.
Compostas por torres com instrumentos de observação como sensores remotos, as estações fixas permitirão realizar observações sobre os impactos das mudanças climáticas nos ecossistemas. Já as realocáveis, que mudarão de posição em períodos de cinco a dez anos, serão focadas na observação de alterações promovidas na biodiversidade pelo uso da terra e por espécies invasivas.
Para complementar as observações realizadas pelas 60 estações de observação terrestres também serão utilizadas três plataformas de observação aérea. Os dispositivos medirão propriedades bioquímicas e biofísicas e o tipo de cobertura de vegetação, entre outras características, por meio de instrumentos como espectrômetro de massa.
“Instalaremos três conjuntos desses instrumentos em aeronaves, que realizarão medições nas estações de observação da Neon e em seu redor, em um raio de até 200 ou 300 quilômetros”, disse Keller.
Os dados coletados pelas estações de observação serão analisados em campo ou em um dos dez laboratórios móveis que também integrarão a infraestrutura da Neon. E, de acordo com Keller, deverão ser disponibilizados rapidamente no site do projeto.
“Todos os dados serão abertos e fornecidos gratuitamente a cientistas de qualquer região do mundo. Queremos que as informações geradas pela Neon sejam utilizadas e analisadas pelo maior número de pesquisadores para que as previsões ecológicas possam ser as mais exatas possíveis”, afirmou.
Mais informações: www.neoninc.org
Células-tronco de líquido amniótico podem gerar todo tipo de células do corpo
Stem Cells from Amniotic Fluid: Reprogrammed Amniotic Fluid Cells Can Generate All Types of Body Cells
ScienceDaily (Nov. 25, 2010) — Reprogrammed amniotic fluid cells can generate all types of body cells. High hopes rest on stem cells: one day, they may be used to treat many diseases. To date, embryos are the main source of these cells, but this raises ethical problems. Scientists at the Max Planck Institute for Molecular Genetics in Berlin have now managed to convert amniotic fluid cells into pluripotent stem cells. These amniotic fluid-derived iPS cells are hardly distinguishable from embryonic stem cells. However, they "remember" where they came from.
Top: Before their reprogramming into amniotic fluid iPS cells, human amniotic fluid cells are outwardly distinguishable from embryonic stem cells. Bottom left: Amniotic fluid iPS cells produce OCT4 (green), one of the most important marker proteins for embryonic stem cells. Bottom right: Starting from this embryonic stem cell phase, the amniotic fluid iPS cells can form hepatocyte-like cells and others. They produce the plasma protein alpha-fetoprotein (red), which is abundant in fetal liver. (Credit: Max Planck Institute for Molecular Genetics)
The research appears in the online journal PLoS ONE, published by the Public Library of Science.
The special abilities of embryonic stem cells can today be used in multiple "grown-up" cells (e.g. skin and hair cells). This is done by reprogramming the cells and converting them to "induced pluripotent stem cells" (iPS cells). These then possess the typical properties of embryonic stem cells, meaning they can generate any of the cell types of the human body (pluripotency), and they can multiply endlessly.
Stem cells with memory
The scientists have shown that the amniotic fluid iPS cells can form different human cell types. They have also discovered that induced pluripotent stem cells can remember the original cell type from which they were generated. During cellular reprogramming, various genes that control the development of stem cells are apparently switched on or remain active. This confirms other current research results, which show that iPS cells derived from distinct tissues are prone to follow their pre-destined developmental path upon spontaneous differentiation. "We don't know just yet whether this donor-cell type memory will have an impact on possible medical treatment, or which type of somatic cell-derived iPS cell will be most suitable for treatment," cautions Katharina Wolfrum of the Max Planck Institute for Molecular Genetics.
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The LARGE Principle of Cellular Reprogramming: Lost, Acquired and Retained Gene Expression in Foreskin and Amniotic Fluid-Derived Human iPS Cells
Katharina Wolfrum1,2, Ying Wang1, Alessandro Prigione1,Karl Sperling3, Hans Lehrach1, James Adjaye1,4*
1 Molecular Embryology and Aging Group, Department of Vertebrate Genomics, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany, 2Institute of Chemistry and Biochemistry, Department of Biology, Chemistry, and Pharmacy, Freie Universität Berlin, Berlin, Germany, 3 Institute of Human Genetics, Charité - Universitätsmedizin Berlin, Berlin, Germany, 4 Stem Cell Unit, Department of Anatomy, Medical College, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia
Abstract
Human amniotic fluid cells (AFCs) are routinely obtained for prenatal diagnostics procedures. Recently, it has been illustrated that these cells may also serve as a valuable model system to study developmental processes and for application in regenerative therapies. Cellular reprogramming is a means of assigning greater value to primary AFCs by inducing self-renewal and pluripotency and, thus, bypassing senescence. Here, we report the generation and characterization of human amniotic fluid-derived induced pluripotent stem cells (AFiPSCs) and demonstrate their ability to differentiate into the trophoblast lineage after stimulation with BMP2/BMP4. We further carried out comparative transcriptome analyses of primary human AFCs, AFiPSCs, fibroblast-derived iPSCs (FiPSCs) and embryonic stem cells (ESCs). This revealed that the expression of key senescence-associated genes are down-regulated upon the induction of pluripotency in primary AFCs (AFiPSCs). By defining distinct and overlapping gene expression patterns and deriving the LARGE (Lost, Acquired and Retained Gene Expression) Principle of Cellular Reprogramming, we could further highlight that AFiPSCs, FiPSCs and ESCs share a core self-renewal gene regulatory network driven by OCT4, SOX2 and NANOG. Nevertheless, these cell types are marked by distinct gene expression signatures. For example, expression of the transcription factors, SIX6, EGR2, PKNOX2, HOXD4, HOXD10, DLX5 and RAXL1, known to regulate developmental processes, are retained in AFiPSCs and FiPSCs. Surprisingly, expression of the self-renewal-associated gene PRDM14 or the developmental processes-regulating genes WNT3A and GSC are restricted to ESCs. Implications of this, with respect to the stability of the undifferentiated state and long-term differentiation potential of iPSCs, warrant further studies.
Citation: Wolfrum K, Wang Y, Prigione A, Sperling K, Lehrach H, et al. (2010) The LARGE Principle of Cellular Reprogramming: Lost, Acquired and Retained Gene Expression in Foreskin and Amniotic Fluid-Derived Human iPS Cells. PLoS ONE 5(10): e13703. doi:10.1371/journal.pone.0013703
Editor: Zhongjun Zhou, The University of Hong Kong, Hong Kong
Received: July 13, 2010; Accepted: October 6, 2010; Published: October 29, 2010
Copyright: © 2010 Wolfrum et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
Funding: The authors acknowledge support from the Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF, Federal Ministry of Education and Research, www.bmbf.de; A.P.: 01GN0807; Y.W., J.A.: 0315398G) and the Max Planck Society (www.mpg.de). Contributions of K.W. were also made possible by funding from the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, www.dfg.de) through the Berlin-Brandenburg School for Regenerative Therapies (BSRT, www.bsrt.de) GSC 203. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.
Competing interests: The authors have declared that no competing interests exist.
* E-mail: adjaye@molgen.mpg.de
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Brazilian Meeting on Research Integrity, Science and Publication Ethics
Brazilian Meeting on Research Integrity, Science and Publication Ethics
25/11/2010
De 10/12/2010 a 16/12/2010
Agência FAPESP – O Brazilian Meeting on Research Integrity, Science and Publication Ethics (Brispe) será realizado de 10 a 16 de dezembro.
Organizado pelo Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de Engenharia (Coppe) e pelo Instituto de Bioquímica Médica da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), o objetivo do evento é promover uma ampla discussão sobre integridade e ética na pesquisa científica para coibir a prática de plágio.
O evento será realizado em diversas instituições do Rio de Janeiro e de São Paulo, como a Coppe, o Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas (CBPF), a Universidade de São Paulo (USP) e o Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (Inpe).
Durante o encontro, pesquisadores do Brasil e do exterior, de diferentes áreas, discutirão sobre códigos nacionais e internacionais de conduta para cientistas e novos pesquisadores e a responsabilidade de editores científicos na promoção de padrões éticos.
Estão confirmadas a participação de Nicholas Steneck, da National Science Foundation (NSF), e de Elizabeth Wager, presidente do Committee on Publication Ethics, ambos dos Estados Unidos.
As inscrições para o evento são gratuitas e devem ser feitas pelo endereço: www.ibrispe.coppe.ufrj.br.
Biólogos afirmam que os ursos polares dificilmente sobreviverão em um mundo mais quente
Polar Bears Unlikely to Survive in Warmer World, Biologists Say
ScienceDaily (Nov. 24, 2010) — Will polar bears survive in a warmer world? UCLA life scientists present new evidence that their numbers are likely to dwindle.
Climate change will force polar bears south, where they are unsuited for the diet. (Credit: Alan D. Wilson)
As polar bears lose habitat due to global warming, these biologists say, they will be forced southward in search of alternative sources of food, where they will increasingly come into competition with grizzly bears.
To test how this competition might unfold, the UCLA biologists constructed three-dimensional computer models of the skulls of polar bears and grizzly bears -- a subspecies of brown bears -- and simulated the process of biting. The models enabled them to compare the two species in terms of how hard they can bite and how strong their skulls are.
"What we found was striking," said Graham Slater, a National Science Foundation-funded UCLA postdoctoral scholar in ecology and evolutionary biology and lead author of the research. "The polar bear and brown bear can bite equally hard, but the polar bear's skull is a much weaker structure."
The implication is that polar bears are likely to lose out in competition for food to grizzlies as warmer temperatures bring them into the same environments, because grizzlies' stronger skulls are better suited to a plant-rich diet, said Slater and Blaire Van Valkenburgh, UCLA professor of ecology and evolutionary biology and senior author of the research.
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Read more here/Leia mais aqui: Science Daily
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Biomechanical Consequences of Rapid Evolution in the Polar Bear Lineage
Graham J. Slater1*, Borja Figueirido2, Leeann Louis3, Paul Yang1, Blaire Van Valkenburgh1
1 Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California Los Angeles, Los Angeles, California, United States of America, 2 Departamento de Ecología y Geología, Área de Paleontología, Facultad de Ciencias, Universidad de Málaga, Campus Universitario de Teatinos, Málaga, Spain, 3Cornell University Museum of Vertebrates, Ithaca, New York, United States of America
Abstract
The polar bear is the only living ursid with a fully carnivorous diet. Despite a number of well-documented craniodental adaptations for a diet of seal flesh and blubber, molecular and paleontological data indicate that this morphologically distinct species evolved less than a million years ago from the omnivorous brown bear. To better understand the evolution of this dietary specialization, we used phylogenetic tests to estimate the rate of morphological specialization in polar bears. We then used finite element analysis (FEA) to compare the limits of feeding performance in the polar bear skull to that of the phylogenetically and geographically close brown bear. Results indicate that extremely rapid evolution of semi-aquatic adaptations and dietary specialization in the polar bear lineage produced a cranial morphology that is weaker than that of brown bears and less suited to processing tough omnivorous or herbivorous diets. Our results suggest that continuation of current climate trends could affect polar bears by not only eliminating their primary food source, but also through competition with northward advancing, generalized brown populations for resources that they are ill-equipped to utilize.
Citation: Slater GJ, Figueirido B, Louis L, Yang P, Van Valkenburgh B (2010) Biomechanical Consequences of Rapid Evolution in the Polar Bear Lineage. PLoS ONE 5(11): e13870. doi:10.1371/journal.pone.0013870
Editor: Andrew Allen Farke, Raymond M. Alf Museum of Paleontology, United States of America
Received: July 2, 2010; Accepted: October 18, 2010; Published: November 5, 2010
Copyright: © 2010 Slater et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
Funding: The work was funded by the National Science Foundation (http://www.nsf.gov/) NSF 0709792, 0517748; Ministerio de Cinencia E Innovacion (http://www.micinn.es/portal/site/MICINN/). The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.
Competing interests: The authors have declared that no competing interests exist.
* E-mail: gslater@ucla.edu
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