Chrichton 'falou e disse': se for consenso, não é ciência e estão roubando sua carteira
Eu sempre afirmei neste blog que eu era cético do aquecimento global ser antropogenicamente produzido. Razões? Apenas uma bastaria: a Idade do Gelo foi antropogenicamente provocada? Mudanças climáticas bruscas sempre ocorreram em diversas eras da humanidade, e esta é apenas uma entre muitas que já ocorreram.
Embore discorde de muitas opiniões de Michael Chrichton, eu sempre considerei suas afirmações merecedoras de, pelo menos, atenção devida:
I want to pause here and talk about this notion of consensus, and the rise of what has been called consensus science. I regard consensus science as an extremely pernicious development that ought to be stopped cold in its tracks. Historically, the claim of consensus has been the first refuge of scoundrels; it is a way to avoid debate by claiming that the matter is already settled. Whenever you hear the consensus of scientists agrees on something or other, reach for your wallet, because you're being had.
Let's be clear: the work of science has nothing whatever to do with consensus. Consensus is the business of politics. Science, on the contrary, requires only one investigator who happens to be right, which means that he or she has results that are verifiable by reference to the real world. In science consensus is irrelevant. What is relevant is reproducible results. The greatest scientists in history are great precisely because they broke with the consensus.
There is no such thing as consensus science. If it's consensus, it isn't science. If it's science, it isn't consensus. Period.
Source/Fonte.
Além disso, eu sempre alertei aqui: Quando você ouvir a palavra 'consenso' em ciência, procure por sua carteira epistêmica, pois ela pode estar sendo tungada! E por gente que deveria perseguir a verdade objetivamente...
Ciência, você é feita apenas por meros mortais. Meros mortais demais...
Os blogs do 'anel científico' estão abordando este comportamento aético dos cientistas? De que maneira? Nada podeis contra a verdade, a não ser pela verdade!
Por mim, esta corja de cientistas deveria devolver o dinheiro público investido nessas pesquisas, ser julgada e, se culpada, cumprir pena como qualquer Fernandinho Beira-mar.
Fui, nem sei por que, meio vindicado dos ataques cibernéticos cruéis da Galera dos meninos e meninas de Darwin. Um bando de "trolls"...
+++++
"A invocação de 'ciência de consenso' é meramente uma tática para proteger a má ciência de escrutínio. A 'ciência de consenso' está para ciência, assim como a lavagem de dinheiro está para a finaça." Michael Egnor.
“Invocation of ‘consensus science’ is merely a tactic to insulate bad science from scrutiny. ‘Consensus science’ is to science as money-laundering is to finance.” Michael Egnor.
Embore discorde de muitas opiniões de Michael Chrichton, eu sempre considerei suas afirmações merecedoras de, pelo menos, atenção devida:
I want to pause here and talk about this notion of consensus, and the rise of what has been called consensus science. I regard consensus science as an extremely pernicious development that ought to be stopped cold in its tracks. Historically, the claim of consensus has been the first refuge of scoundrels; it is a way to avoid debate by claiming that the matter is already settled. Whenever you hear the consensus of scientists agrees on something or other, reach for your wallet, because you're being had.
Let's be clear: the work of science has nothing whatever to do with consensus. Consensus is the business of politics. Science, on the contrary, requires only one investigator who happens to be right, which means that he or she has results that are verifiable by reference to the real world. In science consensus is irrelevant. What is relevant is reproducible results. The greatest scientists in history are great precisely because they broke with the consensus.
There is no such thing as consensus science. If it's consensus, it isn't science. If it's science, it isn't consensus. Period.
Source/Fonte.
Além disso, eu sempre alertei aqui: Quando você ouvir a palavra 'consenso' em ciência, procure por sua carteira epistêmica, pois ela pode estar sendo tungada! E por gente que deveria perseguir a verdade objetivamente...
Ciência, você é feita apenas por meros mortais. Meros mortais demais...
Os blogs do 'anel científico' estão abordando este comportamento aético dos cientistas? De que maneira? Nada podeis contra a verdade, a não ser pela verdade!
Por mim, esta corja de cientistas deveria devolver o dinheiro público investido nessas pesquisas, ser julgada e, se culpada, cumprir pena como qualquer Fernandinho Beira-mar.
Fui, nem sei por que, meio vindicado dos ataques cibernéticos cruéis da Galera dos meninos e meninas de Darwin. Um bando de "trolls"...
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"A invocação de 'ciência de consenso' é meramente uma tática para proteger a má ciência de escrutínio. A 'ciência de consenso' está para ciência, assim como a lavagem de dinheiro está para a finaça." Michael Egnor.
“Invocation of ‘consensus science’ is merely a tactic to insulate bad science from scrutiny. ‘Consensus science’ is to science as money-laundering is to finance.” Michael Egnor.
As três estratégias para lidar com os céticos
Segundo Judith Curry, são três as estratégias para lidar com os céticos:
Fonte
1. Refugiar-se na torre de marfim.
Fonte 2. Cercar os vagões/apontar as armas para fora: argumentos ad hominem/apelo para motivar ataques; apelo à autoridade; isolar o inimigo através da falta de acesso aos dados; revisão por pares.
3. Tomar a atitude “mais elevada": lidar com os céticos de acordo com os nossos termos (conferências, blogoesfera); tornar os dados/métodos disponíveis/transparentes; esclarecer as incertezas; declarar abertamente os nossos valores.
+++++
NOTA CAUSTICANTE DESTE BLOGGER:
Qual foi a estratégia adotada até hoje (2009) pela Nomenklatura científica e Grande Mídia internacional e tupiniquim em relação aos céticos e dissidentes de Darwin? Alternativas 1 e 2.
A alternativa 3 está mais difícil de acontecer aqui em Pindorama, pois a regra # 1 é: "Não damos espaço!" (Marcelo Leite, Folha de São Paulo, no encerramento de conferência sobre evolução na Fac. de Medicina da USP, São Paulo, 2006)
Fonte
1. Refugiar-se na torre de marfim.
Fonte 2. Cercar os vagões/apontar as armas para fora: argumentos ad hominem/apelo para motivar ataques; apelo à autoridade; isolar o inimigo através da falta de acesso aos dados; revisão por pares.
3. Tomar a atitude “mais elevada": lidar com os céticos de acordo com os nossos termos (conferências, blogoesfera); tornar os dados/métodos disponíveis/transparentes; esclarecer as incertezas; declarar abertamente os nossos valores.
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NOTA CAUSTICANTE DESTE BLOGGER:
Qual foi a estratégia adotada até hoje (2009) pela Nomenklatura científica e Grande Mídia internacional e tupiniquim em relação aos céticos e dissidentes de Darwin? Alternativas 1 e 2.
A alternativa 3 está mais difícil de acontecer aqui em Pindorama, pois a regra # 1 é: "Não damos espaço!" (Marcelo Leite, Folha de São Paulo, no encerramento de conferência sobre evolução na Fac. de Medicina da USP, São Paulo, 2006)
Pinguins e leões marinhos ajudam a produzir novo atlas
Penguins and Sea Lions Help Produce New Atlas
ScienceDaily (Nov. 27, 2009) — Recording hundreds of thousands of individual uplinks from satellite transmitters fitted on penguins, albatrosses, sea lions, and other marine animals, the Wildlife Conservation Society (WCS) and BirdLife International have released the first-ever atlas of the Patagonian Sea -- a globally important but poorly understood South American marine ecosystem.
The atlas contains the most accurate maps ever assembled for this ecosystem revealing key migratory corridors that span from coastlines to deep-sea feeding areas off the continental shelf hundreds of miles away.
Southern elephant seals were fitted with GPS collars to help provide data for the new atlas. (Credit: Valeria Falabella/Wildlife Conservation Society)
Data for the atlas was gathered by a team of 25 scientists working over a 10-year period -- many of them supported by the National Research Council of Argentina (CONICET). The team tracked 16 species of marine animals, which produced some 280,000 individual uplinks of data over the Patagonian Sea, a huge area ranging from southern Brazil to southern Chile.
Called Atlas of the Patagonian Sea: Species and Spaces, the 300-page book was edited by Valeria Falabella and Claudio Campagna of the Wildlife Conservation Society, and John Croxall of Birdlife International.
The atlas, which is in English and Spanish, will be used to help inform potential policy decisions in the region such as managing fisheries and charting transportation routes of oil tankers. This vast region, which spans 3 million square kilometers (1.1 million square miles), is becoming increasingly threatened by burgeoning development and overfishing.
...
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ScienceDaily (Nov. 27, 2009) — Recording hundreds of thousands of individual uplinks from satellite transmitters fitted on penguins, albatrosses, sea lions, and other marine animals, the Wildlife Conservation Society (WCS) and BirdLife International have released the first-ever atlas of the Patagonian Sea -- a globally important but poorly understood South American marine ecosystem.
The atlas contains the most accurate maps ever assembled for this ecosystem revealing key migratory corridors that span from coastlines to deep-sea feeding areas off the continental shelf hundreds of miles away.
Southern elephant seals were fitted with GPS collars to help provide data for the new atlas. (Credit: Valeria Falabella/Wildlife Conservation Society)
Data for the atlas was gathered by a team of 25 scientists working over a 10-year period -- many of them supported by the National Research Council of Argentina (CONICET). The team tracked 16 species of marine animals, which produced some 280,000 individual uplinks of data over the Patagonian Sea, a huge area ranging from southern Brazil to southern Chile.
Called Atlas of the Patagonian Sea: Species and Spaces, the 300-page book was edited by Valeria Falabella and Claudio Campagna of the Wildlife Conservation Society, and John Croxall of Birdlife International.
The atlas, which is in English and Spanish, will be used to help inform potential policy decisions in the region such as managing fisheries and charting transportation routes of oil tankers. This vast region, which spans 3 million square kilometers (1.1 million square miles), is becoming increasingly threatened by burgeoning development and overfishing.
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Os oceanos estão absorvendo dióxido de carbono mais lentamente
Oceans Absorbing Carbon Dioxide More Slowly, Scientist Finds
ScienceDaily (Nov. 27, 2009) — The world's oceans are absorbing less carbon dioxide (CO2), a Yale geophysicist has found after pooling data taken over the past 50 years. With the oceans currently absorbing over 40 percent of the CO2 emitted by human activity, this could quicken the pace of climate change, according to the study, which appears in the November 25 issue of Geophysical Research Letters.
Pacific Ocean at sunset. The world's oceans are absorbing less carbon dioxide, a Yale geophysicist has found after pooling data taken over the past 50 years. With the oceans currently absorbing over 40 percent of the CO2 emitted by human activity, this could quicken the pace of climate change, (Credit: Copyright Michele Hogan)
Jeffrey Park, professor of geology and geophysics and director of the Yale Institute for Biospheric Studies, used data collected from atmospheric observing stations in Hawaii, Alaska and Antarctica to study the relationship between fluctuations in global temperatures and the global abundance of atmospheric CO2 on interannual (one to 10 years) time scales. A similar study from 20 years ago found a five-month lag between interannual temperature changes and the resulting changes in CO2 levels. Park has now found that this lag has increased from five to at least 15 months.
"No one had updated the analysis from 20 years ago," Park said. "I expected to find some change in the lag time, but the shift was surprisingly large. This is a big change."
...
Read more here/Leia mais aqui.
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Journal Reference:
Park et al. A re-evaluation of the coherence between global-average atmospheric CO2 and temperatures at interannual time scales. Geophysical Research Letters, 2009; 36 (22): L22704 DOI: 10.1029/2009GL040975
A re-evaluation of the coherence between global-average atmospheric CO2 and temperatures at interannual time scales
Jeffrey Park
Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, Connecticut, USA
Frequency-dependent coherence between atmospheric CO2 and historical temperatures reveals climate feedbacks within Earth's carbon cycle. Coherence between interannual fluctuations in global-average temperature and atmospheric CO2 has changed over time. Since 1979, at Mauna Loa and other observation sites, interannual coherence exhibits a 90° phase lag that suggests a direct correlation between temperatures and the time-derivative of CO2. The coherence transition can be explained if the response time of CO2 to a global temperature fluctuation has lengthened from 6 months to at least 15 months. A longer response time may reflect saturation of the oceanic carbon sink, but a transient shift in ocean circulation may play a role. Coherent annual-cycle fluctuations in CO2 and temperature are evident in the 1958–1988 time series, but not since 1979. Coherence of interannual CO2 variations with gridpoint temperature anomalies are strongest in the tropical oceans.
Received 14 September 2009; accepted 22 October 2009; published 25 November 2009.
Citation: Park, J. (2009), A re-evaluation of the coherence between global-average atmospheric CO2 and temperatures at interannual time scales, Geophys. Res. Lett., 36, L22704, doi:10.1029/2009GL040975.
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ScienceDaily (Nov. 27, 2009) — The world's oceans are absorbing less carbon dioxide (CO2), a Yale geophysicist has found after pooling data taken over the past 50 years. With the oceans currently absorbing over 40 percent of the CO2 emitted by human activity, this could quicken the pace of climate change, according to the study, which appears in the November 25 issue of Geophysical Research Letters.
Pacific Ocean at sunset. The world's oceans are absorbing less carbon dioxide, a Yale geophysicist has found after pooling data taken over the past 50 years. With the oceans currently absorbing over 40 percent of the CO2 emitted by human activity, this could quicken the pace of climate change, (Credit: Copyright Michele Hogan)
Jeffrey Park, professor of geology and geophysics and director of the Yale Institute for Biospheric Studies, used data collected from atmospheric observing stations in Hawaii, Alaska and Antarctica to study the relationship between fluctuations in global temperatures and the global abundance of atmospheric CO2 on interannual (one to 10 years) time scales. A similar study from 20 years ago found a five-month lag between interannual temperature changes and the resulting changes in CO2 levels. Park has now found that this lag has increased from five to at least 15 months.
"No one had updated the analysis from 20 years ago," Park said. "I expected to find some change in the lag time, but the shift was surprisingly large. This is a big change."
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Journal Reference:
Park et al. A re-evaluation of the coherence between global-average atmospheric CO2 and temperatures at interannual time scales. Geophysical Research Letters, 2009; 36 (22): L22704 DOI: 10.1029/2009GL040975
A re-evaluation of the coherence between global-average atmospheric CO2 and temperatures at interannual time scales
Jeffrey Park
Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, Connecticut, USA
Frequency-dependent coherence between atmospheric CO2 and historical temperatures reveals climate feedbacks within Earth's carbon cycle. Coherence between interannual fluctuations in global-average temperature and atmospheric CO2 has changed over time. Since 1979, at Mauna Loa and other observation sites, interannual coherence exhibits a 90° phase lag that suggests a direct correlation between temperatures and the time-derivative of CO2. The coherence transition can be explained if the response time of CO2 to a global temperature fluctuation has lengthened from 6 months to at least 15 months. A longer response time may reflect saturation of the oceanic carbon sink, but a transient shift in ocean circulation may play a role. Coherent annual-cycle fluctuations in CO2 and temperature are evident in the 1958–1988 time series, but not since 1979. Coherence of interannual CO2 variations with gridpoint temperature anomalies are strongest in the tropical oceans.
Received 14 September 2009; accepted 22 October 2009; published 25 November 2009.
Citation: Park, J. (2009), A re-evaluation of the coherence between global-average atmospheric CO2 and temperatures at interannual time scales, Geophys. Res. Lett., 36, L22704, doi:10.1029/2009GL040975.
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Falta de transparência e tribalismo só entre a turma do aquecimento global?
"In my opinion, there are two broader issues raised by these emails that are impeding the public credibility of climate research: lack of transparency in climate data, and “tribalism” in some segments of the climate research community that is impeding peer review and the assessment process." Judy Curry, a seasoned climate scientist at Georgia Tech with a particular focus on hurricanes and warming.
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NOTA CAUSTICANTE DESTE BLOGGER:
A falta de transparência e a existência de tribalismo não é exclusividade somente da turma dos 'crentes' (Argh, isso é como cometer assassinato tribal!) do aquecimento ser um fenômeno antropogenicamente provocado: isso ocorre com muito mais frequência na Nomenklatura científica e na Grande Mídia internacional e tupiniquim. Eu sei do que estou falando - conheço esta falta de transparência e tribalismo de perto e de longe!
Um papel evolucionário expandido para a simetria dos genes de flores
An expanded evolutionary role for flower symmetry genes
Lena C Hileman1 and Pilar Cubas2
1Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Kansas, 1200 Sunnyside Ave, Lawrence, Kansas 66045, USA
2Departamento de Genética Molecular de Plantas, Centro Nacional de Biotecnología/CSIC, Campus Universidad Autónoma de Madrid, 28049 Madrid, Spain
author email corresponding author email
Journal of Biology 2009, 8:90doi:10.1186/jbiol193
Published: 6 November 2009
Abstract
CYCLOIDEA (CYC)-like TCP genes are critical for flower developmental patterning. Exciting recent breakthroughs, including a study by Song et al. published in BMC Evolutionary Biology, demonstrate that CYC-like genes have also had an important role in the evolution of flower form.
FREE PDF GRÁTIS
Lena C Hileman1 and Pilar Cubas2
1Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Kansas, 1200 Sunnyside Ave, Lawrence, Kansas 66045, USA
2Departamento de Genética Molecular de Plantas, Centro Nacional de Biotecnología/CSIC, Campus Universidad Autónoma de Madrid, 28049 Madrid, Spain
author email corresponding author email
Journal of Biology 2009, 8:90doi:10.1186/jbiol193
Published: 6 November 2009
Abstract
CYCLOIDEA (CYC)-like TCP genes are critical for flower developmental patterning. Exciting recent breakthroughs, including a study by Song et al. published in BMC Evolutionary Biology, demonstrate that CYC-like genes have also had an important role in the evolution of flower form.
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O que nós ainda não sabemos sobre a AIDS
What we still don't know about AIDS
Miranda Robertson
Journal of Biology 2009, 8:87doi:10.1186/jbiol200
Published: 27 November 2009
First paragraph (this article has no abstract)
A great deal is known about the human immunodeficiency virus (HIV) that causes acquired immune deficiency syndrome (AIDS) [1], one of whose cardinal features is its exquisite adaptation to its human host. It enters the body through damaged epithelia, or more insidiously, through specialized cells (M cells) in the intestinal epithelium whose function is to deliver viruses and bacteria to waiting immune cells in the tissue below. There, the virus binds to a specialized receptor on the surface of one of these cells - the dendritic cells, which play a central part in activating the CD4+ T lymphocytes whose destruction by the virus ultimately and lethally disables the immune system. Recognition of the bound virus causes the dendritic cell to migrate to the lymphoid tissues where it engages with the CD4+ T lymphocytes that it activates. This enables the virus to bind to molecules on the surface of the T cell - a highly specific interaction involving the CD4 molecules that give CD4+ T cells their name and that enables the virus to enter the cell. Once the virus is inside the cell, it produces DNA copies of its genome that integrate into the host DNA where cellular transcriptional regulators specifically induced by activation of CD4+ T cells are instrumental in activating transcription of the viral genome to produce more viruses.
FREE PDF GRÁTIS
+++++
Life and death as a T lymphocyte: from immune protection to HIV pathogenesis
Nienke Vrisekoop* , Judith N Mandl* and Ronald N Germain
Lymphocyte Biology Section, Laboratory of Immunology, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, 10 Center Dr MSC-1892, Bethesda, MD, USA
author email corresponding author email* Contributed equally
Journal of Biology 2009, 8:91doi:10.1186/jbiol198
Published: 27 November 2009
Abstract
Detailed analysis of T cell dynamics in humans is challenging and mouse models can be important tools for characterizing T cell dynamic processes. In a paper just published in Journal of Biology, Marques et al. suggest that a mouse model with its activated CD4+ T cells are deleted has relevance for HIV infection.
FREE PDF GRÁTIS
+++++
Generalized immune activation as a direct result of activated CD4+ T cell killing
Rute Marques1, Adam Williams2,5, Urszula Eksmond1, Andy Wullaert3, Nigel Killeen4, Manolis Pasparakis3, Dimitris Kioussis2 and George Kassiotis1
1Division of Immunoregulation, MRC National Institute for Medical Research, The Ridgeway, London NW7 1AA, UK
2Division of Molecular Immunology, MRC National Institute for Medical Research, The Ridgeway, London NW7 1AA, UK
3Institute for Genetics, University of Cologne, Zülpicher Strasse 47, 50674 Cologne, Germany
4Department of Microbiology and Immunology, University of California, San Francisco, CA 94143, USA
5Department of Immunobiology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT 06520, USA
author email corresponding author email
Journal of Biology 2009, 8:93doi:10.1186/jbiol194
Published: 27 November 2009
Abstract
Background
In addition to progressive CD4+ T cell immune deficiency, HIV infection is characterized by generalized immune activation, thought to arise from increased microbial exposure resulting from diminishing immunity.
Results
Here we report that, in a virus-free mouse model, conditional ablation of activated CD4+ T cells, the targets of immunodeficiency viruses, accelerates their turnover and produces CD4+ T cell immune deficiency. More importantly, activated CD4+ T cell killing also results in generalized immune activation, which is attributable to regulatory CD4+ T cell insufficiency and preventable by regulatory CD4+ T cell reconstitution. Immune activation in this model develops independently of microbial exposure. Furthermore, microbial translocation in mice with conditional disruption of intestinal epithelial integrity affects myeloid but not T cell homeostasis.
Conclusions
Although neither ablation of activated CD4+ T cells nor disruption of intestinal epithelial integrity in mice fully reproduces every aspect of HIV-associated immune dysfunction in humans, ablation of activated CD4+ T cells, but not disruption of intestinal epithelial integrity, approximates the two key immune alterations in HIV infection: CD4+ T cell immune deficiency and generalized immune activation. We therefore propose activated CD4+ T cell killing as a common etiology for both immune deficiency and activation in HIV infection.
FREE PDF GRÁTIS
Miranda Robertson
Journal of Biology 2009, 8:87doi:10.1186/jbiol200
Published: 27 November 2009
First paragraph (this article has no abstract)
A great deal is known about the human immunodeficiency virus (HIV) that causes acquired immune deficiency syndrome (AIDS) [1], one of whose cardinal features is its exquisite adaptation to its human host. It enters the body through damaged epithelia, or more insidiously, through specialized cells (M cells) in the intestinal epithelium whose function is to deliver viruses and bacteria to waiting immune cells in the tissue below. There, the virus binds to a specialized receptor on the surface of one of these cells - the dendritic cells, which play a central part in activating the CD4+ T lymphocytes whose destruction by the virus ultimately and lethally disables the immune system. Recognition of the bound virus causes the dendritic cell to migrate to the lymphoid tissues where it engages with the CD4+ T lymphocytes that it activates. This enables the virus to bind to molecules on the surface of the T cell - a highly specific interaction involving the CD4 molecules that give CD4+ T cells their name and that enables the virus to enter the cell. Once the virus is inside the cell, it produces DNA copies of its genome that integrate into the host DNA where cellular transcriptional regulators specifically induced by activation of CD4+ T cells are instrumental in activating transcription of the viral genome to produce more viruses.
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Life and death as a T lymphocyte: from immune protection to HIV pathogenesis
Nienke Vrisekoop* , Judith N Mandl* and Ronald N Germain
Lymphocyte Biology Section, Laboratory of Immunology, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, 10 Center Dr MSC-1892, Bethesda, MD, USA
author email corresponding author email* Contributed equally
Journal of Biology 2009, 8:91doi:10.1186/jbiol198
Published: 27 November 2009
Abstract
Detailed analysis of T cell dynamics in humans is challenging and mouse models can be important tools for characterizing T cell dynamic processes. In a paper just published in Journal of Biology, Marques et al. suggest that a mouse model with its activated CD4+ T cells are deleted has relevance for HIV infection.
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Generalized immune activation as a direct result of activated CD4+ T cell killing
Rute Marques1, Adam Williams2,5, Urszula Eksmond1, Andy Wullaert3, Nigel Killeen4, Manolis Pasparakis3, Dimitris Kioussis2 and George Kassiotis1
1Division of Immunoregulation, MRC National Institute for Medical Research, The Ridgeway, London NW7 1AA, UK
2Division of Molecular Immunology, MRC National Institute for Medical Research, The Ridgeway, London NW7 1AA, UK
3Institute for Genetics, University of Cologne, Zülpicher Strasse 47, 50674 Cologne, Germany
4Department of Microbiology and Immunology, University of California, San Francisco, CA 94143, USA
5Department of Immunobiology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT 06520, USA
author email corresponding author email
Journal of Biology 2009, 8:93doi:10.1186/jbiol194
Published: 27 November 2009
Abstract
Background
In addition to progressive CD4+ T cell immune deficiency, HIV infection is characterized by generalized immune activation, thought to arise from increased microbial exposure resulting from diminishing immunity.
Results
Here we report that, in a virus-free mouse model, conditional ablation of activated CD4+ T cells, the targets of immunodeficiency viruses, accelerates their turnover and produces CD4+ T cell immune deficiency. More importantly, activated CD4+ T cell killing also results in generalized immune activation, which is attributable to regulatory CD4+ T cell insufficiency and preventable by regulatory CD4+ T cell reconstitution. Immune activation in this model develops independently of microbial exposure. Furthermore, microbial translocation in mice with conditional disruption of intestinal epithelial integrity affects myeloid but not T cell homeostasis.
Conclusions
Although neither ablation of activated CD4+ T cells nor disruption of intestinal epithelial integrity in mice fully reproduces every aspect of HIV-associated immune dysfunction in humans, ablation of activated CD4+ T cells, but not disruption of intestinal epithelial integrity, approximates the two key immune alterations in HIV infection: CD4+ T cell immune deficiency and generalized immune activation. We therefore propose activated CD4+ T cell killing as a common etiology for both immune deficiency and activation in HIV infection.
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Universidade de Cambridge lança site sobre as plantas coletas por Darwin na viagem do HMS Beagle
Um site fantástico e imperdível de ser visitado! É mais um site que vai para a minha lista de preferidos neste blog:
Darwin's Plants from the Beagle Voyage
Darwin's Plants from the Beagle Voyage
De volta ao passado hominídeo
3-D Renderings Bring Ancient Hominids to Life
By Brandon Keim November 25, 2009 | 12:29 pm | Categories: Anthropology, Tech
For decades, paleoartists have told the story of human evolution through sculpture and drawing. Now their tools have evolved, too.
Computers allow a level of detail and control that isn’t possible with other media. Their creations can come closer than ever to bringing our ancestors to life.
“What’s driven my work has always been, ‘I want to see that thing alive. I want to see that world,” said paleoartist Viktor Deak, who provided the reconstructions used in the Becoming Human documentaries, which aired in November on PBS. “Computer graphics is developing to the point where, in movies like “Benjamin Button,” you don’t know what parts are not digital.”
Deak still begins his reconstructions in traditional fashion, sculpting bodies from clay. Like other paleoartists, he doesn’t know what his fossil interpretation will look like when complete, but comes to an understanding of anatomic nuances, of tissue and muscle thickness and how it might have linked to ancient bone, while working with his hands in three dimensions.
Once he’s done, he converts the work to digital format. For a 78-foot-long mural now traveling with Lucy’s Legacy, a touring exhibition featuring the famous 3.2 million year old fossils, he photographed his sculptures and imported them to Photoshop. There he added hundreds of layers of texture and light, tweaking them for maximum combinatorial realism.
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By Brandon Keim November 25, 2009 | 12:29 pm | Categories: Anthropology, Tech
For decades, paleoartists have told the story of human evolution through sculpture and drawing. Now their tools have evolved, too.
Computers allow a level of detail and control that isn’t possible with other media. Their creations can come closer than ever to bringing our ancestors to life.
“What’s driven my work has always been, ‘I want to see that thing alive. I want to see that world,” said paleoartist Viktor Deak, who provided the reconstructions used in the Becoming Human documentaries, which aired in November on PBS. “Computer graphics is developing to the point where, in movies like “Benjamin Button,” you don’t know what parts are not digital.”
Deak still begins his reconstructions in traditional fashion, sculpting bodies from clay. Like other paleoartists, he doesn’t know what his fossil interpretation will look like when complete, but comes to an understanding of anatomic nuances, of tissue and muscle thickness and how it might have linked to ancient bone, while working with his hands in three dimensions.
Once he’s done, he converts the work to digital format. For a 78-foot-long mural now traveling with Lucy’s Legacy, a touring exhibition featuring the famous 3.2 million year old fossils, he photographed his sculptures and imported them to Photoshop. There he added hundreds of layers of texture and light, tweaking them for maximum combinatorial realism.
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Primeiro 'Mapa Genético' dos chineses Han pode ajudar na descoberta de doenças
First 'Genetic Map' of Han Chinese May Aid Search for Disease Susceptibility Genes
ScienceDaily (Nov. 26, 2009) — The first genetic historical map of the Han Chinese, the largest ethnic population in the world, as they migrated from south to north over evolutionary time, was published online November 25 in the American Journal of Human Genetics by scientists at the Genome Institute of Singapore (GIS).
Based on genome-wide DNA variation information in over 6,000 Han Chinese samples from 10 provinces in China, this new map provides information about the population structure and evolutionary history of this group of people that can help scientists to identify subtle differences in the genetic diversity of Asian populations.
DNA on abstract background. Researchers have published the first genetic historical map of the Han Chinese, the largest ethnic population in the world, as they migrated from south to north over evolutionary time. (Credit: iStockphoto/Andrey Prokhorov)
Understanding these differences may aid in the design and interpretation of studies to identify genes that confer susceptibility to such common diseases as diabetes in ethnic Chinese individuals. Understanding these differences also is crucial in exploring how genes and environment interact to cause diseases.
With the genetic map, the GIS scientists were able to show that the northern inhabitants of China were genetically distinguishable from those in the south, a finding that seems very consistent with the Han Chinese's historical migration pattern.
The genetic map also revealed that the genetic divergence was closely correlated with the geographic map of China. This finding suggests the persistence of local co-ancestry in the country.
"The genome-wide genetic variation study is a powerful tool which may be used to infer a person's ancestral origin and to study population relationships," said Liu Jianjun, Ph.D., GIS Human Genetics Group Leader.
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Journal Reference:
Jieming Chen et al. Genetic Structure of the Han Chinese Population Revealed by Genome-wide SNP Variation. American Journal of Human Genetics, November 25, 2009
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Professores, pesquisadores e alunos de universidades públicas e privadas com acesso ao site CAPES/Periódicos podem ler gratuitamente estes artigos do American Journal of Human Genetics e de outras publicações científicas.
ScienceDaily (Nov. 26, 2009) — The first genetic historical map of the Han Chinese, the largest ethnic population in the world, as they migrated from south to north over evolutionary time, was published online November 25 in the American Journal of Human Genetics by scientists at the Genome Institute of Singapore (GIS).
Based on genome-wide DNA variation information in over 6,000 Han Chinese samples from 10 provinces in China, this new map provides information about the population structure and evolutionary history of this group of people that can help scientists to identify subtle differences in the genetic diversity of Asian populations.
DNA on abstract background. Researchers have published the first genetic historical map of the Han Chinese, the largest ethnic population in the world, as they migrated from south to north over evolutionary time. (Credit: iStockphoto/Andrey Prokhorov)
Understanding these differences may aid in the design and interpretation of studies to identify genes that confer susceptibility to such common diseases as diabetes in ethnic Chinese individuals. Understanding these differences also is crucial in exploring how genes and environment interact to cause diseases.
With the genetic map, the GIS scientists were able to show that the northern inhabitants of China were genetically distinguishable from those in the south, a finding that seems very consistent with the Han Chinese's historical migration pattern.
The genetic map also revealed that the genetic divergence was closely correlated with the geographic map of China. This finding suggests the persistence of local co-ancestry in the country.
"The genome-wide genetic variation study is a powerful tool which may be used to infer a person's ancestral origin and to study population relationships," said Liu Jianjun, Ph.D., GIS Human Genetics Group Leader.
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Journal Reference:
Jieming Chen et al. Genetic Structure of the Han Chinese Population Revealed by Genome-wide SNP Variation. American Journal of Human Genetics, November 25, 2009
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'Planta' de 'célula mínima' é mais complexa do que se esperava
First-Ever Blueprint of 'Minimal Cell' Is More Complex Than Expected
ScienceDaily (Nov. 27, 2009) — What are the bare essentials of life, the indispensable ingredients required to produce a cell that can survive on its own? Can we describe the molecular anatomy of a cell, and understand how an entire organism functions as a system? These are just some of the questions that scientists in a partnership between the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) in Heidelberg, Germany, and the Centre de Regulacion Genòmica (CRG) in Barcelona, Spain, set out to address.
In three papers published back-to-back in Science, they provide the first comprehensive picture of a minimal cell, based on an extensive quantitative study of the biology of the bacterium that causes atypical pneumonia, Mycoplasma pneumoniae. The study uncovers fascinating novelties relevant to bacterial biology and shows that even the simplest of cells is more complex than expected.
This image represents the integration of genomic, metabolic, proteomic, structural and cellular information about Mycoplasma pnemoniae in this project: one layer of an Electron Tomography scan of a bottle-shaped M. pneumoniae cell (grey) is overlaid with a schematic representation of this bacterium's metabolism, comprising 189 enzymatic reactions, where blue indicates interactions between proteins encoded in genes from the same functional unit. Apart from these expected interactions, the scientists found that, surprisingly, many proteins are multifunctional. For instance, there were various unexpected physical interactions (yellow lines) between proteins and the subunits that form the ribosome, which is depicted as an Electron microscopy image (yellow). (Credit: Takuji Yamada /EMBL)
Mycoplasma pneumoniae is a small, single-cell bacterium that causes atypical pneumonia in humans. It is also one of the smallest prokaryotes -- organisms whose cells have no nucleus -- that don't depend on a host's cellular machinery to reproduce. This is why the six research groups which set out to characterize a minimal cell in a project headed by scientists Peer Bork, Anne-Claude Gavin and Luis Serrano chose M. pneumoniae as a model: it is complex enough to survive on its own, but small and, theoretically, simple enough to represent a minimal cell -- and to enable a global analysis.
A network of research groups at EMBL's Structural and Computational Biology Unit and CRG's EMBL-CRG Systems Biology Partnership Unit approached the bacterium at three different levels. One team of scientists described M. pneumoniae's transcriptome, identifying all the RNA molecules, or transcripts, produced from its DNA, under various environmental conditions. Another defined all the metabolic reactions that occurred in it, collectively known as its metabolome, under the same conditions. A third team identified every multi-protein complex the bacterium produced, thus characterising its proteome organisation.
"At all three levels, we found M. pneumoniae was more complex than we expected," says Luis Serrano, co-initiator of the project at EMBL and now head of the Systems Biology Department at CRG.
When studying both its proteome and its metabolome, the scientists found many molecules were multifunctional, with metabolic enzymes catalyzing multiple reactions, and other proteins each taking part in more than one protein complex. They also found that M. pneumoniae couples biological processes in space and time, with the pieces of cellular machinery involved in two consecutive steps in a biological process often being assembled together.
Remarkably, the regulation of this bacterium's transcriptome is much more similar to that of eukaryotes -- organisms whose cells have a nucleus -- than previously thought. As in eukaryotes, a large proportion of the transcripts produced from M. pneumoniae's DNA are not translated into proteins. And although its genes are arranged in groups as is typical of bacteria, M. pneumoniae doesn't always transcribe all the genes in a group together, but can selectively express or repress individual genes within each group.
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Journal References:
Kühner et al. Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium. Science, 2009; DOI: 10.1126/science.1176343
Yus et al. Impact of Genome Reduction on Bacterial Metabolism and Its Regulation. Science, 2009; DOI: 10.1126/science.1177263
Güell et al. Transcriptome Complexity in a Genome-Reduced Bacterium. Science, 2009; DOI: 10.1126/science.1176951
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Professores, pesquisadores e alunos de universidades públicas e privadas com acesso ao site CAPES/Periódicos podem ler gratuitamente estes artigos da Science e de outras publicações científicas.
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NOTA IMPERTINENTE DESTE BLOGGER:
O darwinismo 'arrota' ser uma ciência estritamente baconiana. Ora, o espírito baconiano de se fazer ciência é 'ir à natureza, fazer perguntas a ela, e seguir as evidências aonde eles forem dar'. No tocante ao design real encontrado na natureza, nós temos uma 'montanha de evidências' [dêem licença agora, mas o pessoal do Design Inteligente é que pode usar este termo] que apontam para a presença e detecção de design. Se os darwinistas são realmente baconianos como dizem ser, basta seguir as evidências aonde elas forem dar: Design Inteligente!
ScienceDaily (Nov. 27, 2009) — What are the bare essentials of life, the indispensable ingredients required to produce a cell that can survive on its own? Can we describe the molecular anatomy of a cell, and understand how an entire organism functions as a system? These are just some of the questions that scientists in a partnership between the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) in Heidelberg, Germany, and the Centre de Regulacion Genòmica (CRG) in Barcelona, Spain, set out to address.
In three papers published back-to-back in Science, they provide the first comprehensive picture of a minimal cell, based on an extensive quantitative study of the biology of the bacterium that causes atypical pneumonia, Mycoplasma pneumoniae. The study uncovers fascinating novelties relevant to bacterial biology and shows that even the simplest of cells is more complex than expected.
This image represents the integration of genomic, metabolic, proteomic, structural and cellular information about Mycoplasma pnemoniae in this project: one layer of an Electron Tomography scan of a bottle-shaped M. pneumoniae cell (grey) is overlaid with a schematic representation of this bacterium's metabolism, comprising 189 enzymatic reactions, where blue indicates interactions between proteins encoded in genes from the same functional unit. Apart from these expected interactions, the scientists found that, surprisingly, many proteins are multifunctional. For instance, there were various unexpected physical interactions (yellow lines) between proteins and the subunits that form the ribosome, which is depicted as an Electron microscopy image (yellow). (Credit: Takuji Yamada /EMBL)
Mycoplasma pneumoniae is a small, single-cell bacterium that causes atypical pneumonia in humans. It is also one of the smallest prokaryotes -- organisms whose cells have no nucleus -- that don't depend on a host's cellular machinery to reproduce. This is why the six research groups which set out to characterize a minimal cell in a project headed by scientists Peer Bork, Anne-Claude Gavin and Luis Serrano chose M. pneumoniae as a model: it is complex enough to survive on its own, but small and, theoretically, simple enough to represent a minimal cell -- and to enable a global analysis.
A network of research groups at EMBL's Structural and Computational Biology Unit and CRG's EMBL-CRG Systems Biology Partnership Unit approached the bacterium at three different levels. One team of scientists described M. pneumoniae's transcriptome, identifying all the RNA molecules, or transcripts, produced from its DNA, under various environmental conditions. Another defined all the metabolic reactions that occurred in it, collectively known as its metabolome, under the same conditions. A third team identified every multi-protein complex the bacterium produced, thus characterising its proteome organisation.
"At all three levels, we found M. pneumoniae was more complex than we expected," says Luis Serrano, co-initiator of the project at EMBL and now head of the Systems Biology Department at CRG.
When studying both its proteome and its metabolome, the scientists found many molecules were multifunctional, with metabolic enzymes catalyzing multiple reactions, and other proteins each taking part in more than one protein complex. They also found that M. pneumoniae couples biological processes in space and time, with the pieces of cellular machinery involved in two consecutive steps in a biological process often being assembled together.
Remarkably, the regulation of this bacterium's transcriptome is much more similar to that of eukaryotes -- organisms whose cells have a nucleus -- than previously thought. As in eukaryotes, a large proportion of the transcripts produced from M. pneumoniae's DNA are not translated into proteins. And although its genes are arranged in groups as is typical of bacteria, M. pneumoniae doesn't always transcribe all the genes in a group together, but can selectively express or repress individual genes within each group.
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Journal References:
Kühner et al. Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium. Science, 2009; DOI: 10.1126/science.1176343
Yus et al. Impact of Genome Reduction on Bacterial Metabolism and Its Regulation. Science, 2009; DOI: 10.1126/science.1177263
Güell et al. Transcriptome Complexity in a Genome-Reduced Bacterium. Science, 2009; DOI: 10.1126/science.1176951
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O darwinismo 'arrota' ser uma ciência estritamente baconiana. Ora, o espírito baconiano de se fazer ciência é 'ir à natureza, fazer perguntas a ela, e seguir as evidências aonde eles forem dar'. No tocante ao design real encontrado na natureza, nós temos uma 'montanha de evidências' [dêem licença agora, mas o pessoal do Design Inteligente é que pode usar este termo] que apontam para a presença e detecção de design. Se os darwinistas são realmente baconianos como dizem ser, basta seguir as evidências aonde elas forem dar: Design Inteligente!
UFPB sedia congresso internacional de Educação Biocêntrica
sexta-feira, novembro 27, 2009
JC e-mail 3899, de 27 de Novembro de 2009.
26. UFPB sedia congresso internacional de Educação Biocêntrica
Evento acontece no próximo ano. Primeiro prazo para inscrições com desconto termina em 5 de dezembro
O I Congresso Internacional de Educação Biocêntrica vai ocorrer em João Pessoa, no período de 2 a 5 de setembro de 2010. O evento será organizado pela Universidade Federal da Paraíba (UFPB), por meio do Centro de Educação, da International Biocentric Foudantion e o Programa de Pós-Graduação em Educação.
Os participantes do congresso desenvolverão trabalhos focados em temas como Aprendizagem Vital e Educação Biocêntrica; Música e Movimento na Educação Biocêntrica; Corporeidade e Educação Biocêntrica; Biodança para Crianças e Jovens; Educação Biocêntrica, Sustentabilidade e Educação Ambiental.
O primeiro prazo para inscrições com desconto termina em 5 de dezembro. Mais informações pelo fone (83) 3216-7715, no site www.educacaobiocentrica.com.br ou e-mail congresso@educacaobiocentrica.com.br
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A diretora da Escola de Educação Biocêntrica, Elisa Gonsalves, é minha amiga que conheci quando ela fazia doutorado em Educação na Unimep, Piracicaba, SP.
26. UFPB sedia congresso internacional de Educação Biocêntrica
Evento acontece no próximo ano. Primeiro prazo para inscrições com desconto termina em 5 de dezembro
O I Congresso Internacional de Educação Biocêntrica vai ocorrer em João Pessoa, no período de 2 a 5 de setembro de 2010. O evento será organizado pela Universidade Federal da Paraíba (UFPB), por meio do Centro de Educação, da International Biocentric Foudantion e o Programa de Pós-Graduação em Educação.
Os participantes do congresso desenvolverão trabalhos focados em temas como Aprendizagem Vital e Educação Biocêntrica; Música e Movimento na Educação Biocêntrica; Corporeidade e Educação Biocêntrica; Biodança para Crianças e Jovens; Educação Biocêntrica, Sustentabilidade e Educação Ambiental.
O primeiro prazo para inscrições com desconto termina em 5 de dezembro. Mais informações pelo fone (83) 3216-7715, no site www.educacaobiocentrica.com.br ou e-mail congresso@educacaobiocentrica.com.br
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A diretora da Escola de Educação Biocêntrica, Elisa Gonsalves, é minha amiga que conheci quando ela fazia doutorado em Educação na Unimep, Piracicaba, SP.
Fiocruz Amazônia oferece doutorado em Saúde Pública em Manaus
JC e-mail 3899, de 27 de Novembro de 2009.
27. Fiocruz Amazônia oferece doutorado em Saúde Pública em Manaus
Inscrições até 11 de dezembro
Com o objetivo de formar doutores capacitados a conduzir pesquisas em áreas específicas e docentes para o ensino superior e para a pós-graduação, comprometidos com uma visão contemporânea da temática regional, nacional e internacional na área da saúde coletiva, o Centro de Pesquisa Leônidas e Maria Deane (CPqLMD), unidade da Fiocruz na Amazônia abrirá sua segunda turma de doutorado na área de saúde coletiva em Manaus em 2010.
São oferecidas 20 vagas direcionadas aos profissionais com título de mestre em áreas do conhecimento relacionadas à saúde coletiva.
A instituição conta com apoio da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (Fapeam).
O edital pode ser consultado aqui [PDF].
27. Fiocruz Amazônia oferece doutorado em Saúde Pública em Manaus
Inscrições até 11 de dezembro
Com o objetivo de formar doutores capacitados a conduzir pesquisas em áreas específicas e docentes para o ensino superior e para a pós-graduação, comprometidos com uma visão contemporânea da temática regional, nacional e internacional na área da saúde coletiva, o Centro de Pesquisa Leônidas e Maria Deane (CPqLMD), unidade da Fiocruz na Amazônia abrirá sua segunda turma de doutorado na área de saúde coletiva em Manaus em 2010.
São oferecidas 20 vagas direcionadas aos profissionais com título de mestre em áreas do conhecimento relacionadas à saúde coletiva.
A instituição conta com apoio da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (Fapeam).
O edital pode ser consultado aqui [PDF].
Mestrado em Biotecnologia na Universidade Federal de Ouro Preto (Ufop)
JC e-mail 3899, de 27 de Novembro de 2009.
28. Mestrado em Biotecnologia na Universidade Federal de Ouro Preto (Ufop)
Inscrição termina em 7 de dezembro
São 10 vagas para a área de Biotecnologia aplicada a processos e ao tratamento de doenças e quatro para a área de Genômica e Proteômica.
Mais informações no site www.nupeb.ufop.br/biotec ou e-mail biotec@nupeb.ufop.br
28. Mestrado em Biotecnologia na Universidade Federal de Ouro Preto (Ufop)
Inscrição termina em 7 de dezembro
São 10 vagas para a área de Biotecnologia aplicada a processos e ao tratamento de doenças e quatro para a área de Genômica e Proteômica.
Mais informações no site www.nupeb.ufop.br/biotec ou e-mail biotec@nupeb.ufop.br
Análise genômica comparativa e filogeográfica do Mycobacterium leprae
Article abstract
Nature Genetics 41, 1282 - 1289 (2009)
Published online: 1 November 2009 | doi:10.1038/ng.477
Comparative genomic and phylogeographic analysis of Mycobacterium leprae
Marc Monot1,19, Nadine Honoré1,19, Thierry Garnier1, Nora Zidane1, Diana Sherafi1, Alberto Paniz-Mondolfi2, Masanori Matsuoka3, G Michael Taylor4, Helen D Donoghue4, Abi Bouwman5, Simon Mays6, Claire Watson7, Diana Lockwood7, Ali Khamispour8, Yahya Dowlati8, Shen Jianping9, Thomas H Rea10, Lucio Vera-Cabrera11, Mariane M Stefani12, Sayera Banu13, Murdo Macdonald14, Bishwa Raj Sapkota14, John S Spencer15, Jérôme Thomas16, Keith Harshman16, Pushpendra Singh17, Philippe Busso17, Alexandre Gattiker18, Jacques Rougemont18, Patrick J Brennan15 & Stewart T Cole17
Abstract
Reductive evolution and massive pseudogene formation have shaped the 3.31-Mb genome of Mycobacterium leprae, an unculturable obligate pathogen that causes leprosy in humans. The complete genome sequence of M. leprae strain Br4923 from Brazil was obtained by conventional methods (6 coverage), and Illumina resequencing technology was used to obtain the sequences of strains Thai53 (38coverage) and NHDP63 (46 coverage) from Thailand and the United States, respectively. Whole-genome comparisons with the previously sequenced TN strain from India revealed that the four strains share 99.995% sequence identity and differ only in 215 polymorphic sites, mainly SNPs, and by 5 pseudogenes. Sixteen interrelated SNP subtypes were defined by genotyping both extant and extinct strains of M. leprae from around the world. The 16 SNP subtypes showed a strong geographical association that reflects the migration patterns of early humans and trade routes, with the Silk Road linking Europe to China having contributed to the spread of leprosy.
top of page
Institut Pasteur, Paris, France.
Instituto de Biomedicina, Caracas, Venezuela.
Leprosy Research Centre, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan.
Centre for Infectious Diseases and International Health, Windeyer Institute, University College London, London, UK.
Faculty of Life Sciences, Manchester Interdisciplinary Biocentre, University of Manchester, Manchester, UK.
Ancient Monuments Laboratory, English Heritage Centre for Archaeology, Fort Cumberland, Portsmouth, UK.
London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK.
Center for Research and Training in Skin Diseases and Leprosy, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
National Center for Leprosy Control, China Center for Disease Control and Prevention, Nanjing, China.
Department of Dermatology, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California, USA.
Servicio de Dermatología, Hospital Universitario 'José E. González', Monterrey, Nuevo León, México.
Tropical Pathology and Public Health Institute at Federal University of Goias, Setor Universitario, Goiania, Goias, Brazil.
International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Dhaka, Bangladesh.
Leprosy Mission Nepal, Anandaban Hospital, Kathmandu, Nepal.
Department of Microbiology, Immunology and Pathology, Colorado State University, Fort Collins, Colorado, USA.
DNA Array Facility, Center for Integrative Genomics, University of Lausanne, Lausanne, Switzerland.
Global Health Institute, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne, Switzerland.
Bioinformatics and Biostatistics Core Facility, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne, Switzerland.
These authors contributed equally to this work.
Correspondence to: Stewart T Cole17 e-mail: stewart.cole@epfl.ch
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FREE PDF GRÁTIS
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Tirando o chapéu para John Hawks, um blogger que não permite comentários em seu blog. Eu sigo o exemplo dele. Será que pelos critérios draconianos do Research Blogging, o blog do John Hawks não é um blog científico???
Nature Genetics 41, 1282 - 1289 (2009)
Published online: 1 November 2009 | doi:10.1038/ng.477
Comparative genomic and phylogeographic analysis of Mycobacterium leprae
Marc Monot1,19, Nadine Honoré1,19, Thierry Garnier1, Nora Zidane1, Diana Sherafi1, Alberto Paniz-Mondolfi2, Masanori Matsuoka3, G Michael Taylor4, Helen D Donoghue4, Abi Bouwman5, Simon Mays6, Claire Watson7, Diana Lockwood7, Ali Khamispour8, Yahya Dowlati8, Shen Jianping9, Thomas H Rea10, Lucio Vera-Cabrera11, Mariane M Stefani12, Sayera Banu13, Murdo Macdonald14, Bishwa Raj Sapkota14, John S Spencer15, Jérôme Thomas16, Keith Harshman16, Pushpendra Singh17, Philippe Busso17, Alexandre Gattiker18, Jacques Rougemont18, Patrick J Brennan15 & Stewart T Cole17
Abstract
Reductive evolution and massive pseudogene formation have shaped the 3.31-Mb genome of Mycobacterium leprae, an unculturable obligate pathogen that causes leprosy in humans. The complete genome sequence of M. leprae strain Br4923 from Brazil was obtained by conventional methods (6 coverage), and Illumina resequencing technology was used to obtain the sequences of strains Thai53 (38coverage) and NHDP63 (46 coverage) from Thailand and the United States, respectively. Whole-genome comparisons with the previously sequenced TN strain from India revealed that the four strains share 99.995% sequence identity and differ only in 215 polymorphic sites, mainly SNPs, and by 5 pseudogenes. Sixteen interrelated SNP subtypes were defined by genotyping both extant and extinct strains of M. leprae from around the world. The 16 SNP subtypes showed a strong geographical association that reflects the migration patterns of early humans and trade routes, with the Silk Road linking Europe to China having contributed to the spread of leprosy.
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Institut Pasteur, Paris, France.
Instituto de Biomedicina, Caracas, Venezuela.
Leprosy Research Centre, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan.
Centre for Infectious Diseases and International Health, Windeyer Institute, University College London, London, UK.
Faculty of Life Sciences, Manchester Interdisciplinary Biocentre, University of Manchester, Manchester, UK.
Ancient Monuments Laboratory, English Heritage Centre for Archaeology, Fort Cumberland, Portsmouth, UK.
London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK.
Center for Research and Training in Skin Diseases and Leprosy, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
National Center for Leprosy Control, China Center for Disease Control and Prevention, Nanjing, China.
Department of Dermatology, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California, USA.
Servicio de Dermatología, Hospital Universitario 'José E. González', Monterrey, Nuevo León, México.
Tropical Pathology and Public Health Institute at Federal University of Goias, Setor Universitario, Goiania, Goias, Brazil.
International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Dhaka, Bangladesh.
Leprosy Mission Nepal, Anandaban Hospital, Kathmandu, Nepal.
Department of Microbiology, Immunology and Pathology, Colorado State University, Fort Collins, Colorado, USA.
DNA Array Facility, Center for Integrative Genomics, University of Lausanne, Lausanne, Switzerland.
Global Health Institute, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne, Switzerland.
Bioinformatics and Biostatistics Core Facility, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne, Switzerland.
These authors contributed equally to this work.
Correspondence to: Stewart T Cole17 e-mail: stewart.cole@epfl.ch
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Tirando o chapéu para John Hawks, um blogger que não permite comentários em seu blog. Eu sigo o exemplo dele. Será que pelos critérios draconianos do Research Blogging, o blog do John Hawks não é um blog científico???
Leia aqui os e-mails do Climategate que você não lerá em outros meios de informação
Al 'Apocalipse' Gore e gang devem estar bastante frustrados e contrariados com os e-mails que foram hackerizados dos computadores do Climate Research Unit (CRU) na University of East Anglia. Muito mais contrariados porque a lista pode ser lida aqui.
A Nomenklatura científica, a Grande Mídia internacional e tupiniquim, em tácito acordo, não deram espaço para os dissidentes, como este blogger, mas eu queria ver a cara deles agora que os cientistas bandidos foram apanhados com a mão na cumbuca!!!
Relembrando um bordão: aqui neste blog, a gente mata a cobra e mostra o pau!!!
A Nomenklatura científica, a Grande Mídia internacional e tupiniquim, em tácito acordo, não deram espaço para os dissidentes, como este blogger, mas eu queria ver a cara deles agora que os cientistas bandidos foram apanhados com a mão na cumbuca!!!
Relembrando um bordão: aqui neste blog, a gente mata a cobra e mostra o pau!!!
Um duplo olhar para a ciência - Entrevista com Michel Paty
Um duplo olhar para a ciência
O filósofo e físico francês Michel Paty examina as implicações epistemológicas de uma eventual unificação das teorias quântica e da relatividade
Mariluce Moura e Fabrício Marques
Edição Impressa 165 - Novembro 2009
Pesquisa FAPESP - Dificilmente outra personagem pareceria tão ilustrativa do diá logo intelectual possível entre duas nações quanto Michel Paty, no colóquio “Racionalidades franco-brasileiras de ontem e de hoje”, realizado de 14 a 16 de setembro na Faculdade de Filosofia e Ciências Humanas da Universidade de São Paulo (FFLCH-USP), dentro das atividades Ano da França no Brasil. O filósofo e físico francês de 71 anos tem visto sua trajetória profissional, seu trabalho acadêmico e a própria vida pessoal se impregnarem fortemente de experiências brasileiras, desde que aqui aportou pela primeira vez em 1965, para um período de um ano no Departamento de Física da jovem Universidade de Brasília (UnB). Terminou ficando na instituição, assaltada pela violência da ditadura militar naquele ano, por apenas seis meses e preferiu cumprir o resto do período acertado para sua cooperação no país no Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas (CBPF), no Rio de Janeiro. Depois disso, Paty esperou a democracia voltar aos poucos à cena política brasileira e seus amigos cientistas retornarem ao Brasil nos voos da anistia, para recomeçar seus trajetos franco-brasileiros, de variadas formas. Ser professor visitante na USP tem sido uma delas.
© EDUARDO CESAR
Michel Paty: "É a conexão entre o pensamento abstrato e os sentidos que cria uma linha de interação capaz de explicar a correspondência entre o mundo do pensamento e o mundo real"
Ao longo desses anos, marcados de forma sensível pelo trânsito do investigador dos domínios da física de partículas para a filosofia da ciência, as reflexões de Paty sobre o conhecimento científico e, em especial, sobre o presente e o futuro da física ganharam, além de consistência, uma evidente facilidade de expressão. O que se mostra, aliás, num livro acessível a não especialistas como A física do século XX, publicado no Brasil agora em 2009 pela editora Ideias e Letras, com tradução do também fílósofo e professor da USP Pablo Mariconda. Para os que quiserem se aventurar mais pelo olhar crítico de Michel Paty, há um outro livro seu traduzido para o português, A matéria roubada, publicado pela Edusp em 1995, com tradução de Mary Amazonas Leite de Barros. Os originais franceses das duas obras são respectivamente, de 2003 e de 1988.
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O filósofo e físico francês Michel Paty examina as implicações epistemológicas de uma eventual unificação das teorias quântica e da relatividade
Mariluce Moura e Fabrício Marques
Edição Impressa 165 - Novembro 2009
Pesquisa FAPESP - Dificilmente outra personagem pareceria tão ilustrativa do diá logo intelectual possível entre duas nações quanto Michel Paty, no colóquio “Racionalidades franco-brasileiras de ontem e de hoje”, realizado de 14 a 16 de setembro na Faculdade de Filosofia e Ciências Humanas da Universidade de São Paulo (FFLCH-USP), dentro das atividades Ano da França no Brasil. O filósofo e físico francês de 71 anos tem visto sua trajetória profissional, seu trabalho acadêmico e a própria vida pessoal se impregnarem fortemente de experiências brasileiras, desde que aqui aportou pela primeira vez em 1965, para um período de um ano no Departamento de Física da jovem Universidade de Brasília (UnB). Terminou ficando na instituição, assaltada pela violência da ditadura militar naquele ano, por apenas seis meses e preferiu cumprir o resto do período acertado para sua cooperação no país no Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas (CBPF), no Rio de Janeiro. Depois disso, Paty esperou a democracia voltar aos poucos à cena política brasileira e seus amigos cientistas retornarem ao Brasil nos voos da anistia, para recomeçar seus trajetos franco-brasileiros, de variadas formas. Ser professor visitante na USP tem sido uma delas.
© EDUARDO CESAR
Michel Paty: "É a conexão entre o pensamento abstrato e os sentidos que cria uma linha de interação capaz de explicar a correspondência entre o mundo do pensamento e o mundo real"
Ao longo desses anos, marcados de forma sensível pelo trânsito do investigador dos domínios da física de partículas para a filosofia da ciência, as reflexões de Paty sobre o conhecimento científico e, em especial, sobre o presente e o futuro da física ganharam, além de consistência, uma evidente facilidade de expressão. O que se mostra, aliás, num livro acessível a não especialistas como A física do século XX, publicado no Brasil agora em 2009 pela editora Ideias e Letras, com tradução do também fílósofo e professor da USP Pablo Mariconda. Para os que quiserem se aventurar mais pelo olhar crítico de Michel Paty, há um outro livro seu traduzido para o português, A matéria roubada, publicado pela Edusp em 1995, com tradução de Mary Amazonas Leite de Barros. Os originais franceses das duas obras são respectivamente, de 2003 e de 1988.
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Esculpindo com a luz
Esculpindo com a luz
Técnica permite criar micro e nanoestruturas poliméricas de geometria complexa
Yuri Vasconcelos
Edição Impressa 165 - Novembro 2009
Pesquisa FAPESP - A utilização do laser na medicina, nas cirurgias de olhos, por exemplo, e nas telecomunicações, no interior das fibras ópticas, já é bem conhecida. Mas os vários tipos de laser ainda podem ser mais explorados em outras atividades. Atualmente o que se busca na pesquisa científica e tecnológica com esses feixes concentrados de luz é o uso mais ampliado nas escalas de tamanho em micrômetros e nanômetros. Nesse sentido, um passo importante foi dado por pesquisadores do Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo (IFSC/USP). Em parceria com um grupo de pesquisadores da Universidade Harvard, nos Estados Unidos, eles dominaram a técnica óptica que utiliza pulsos ultracurtos de luz laser para fabricar estruturas poliméricas tridimensionais e de geometria complexa que não se podem ver a olho nu. O domínio desse novo processo permitirá, no futuro, a fabricação de dispositivos miniaturizados para circuitos elétricos, microcápsulas para entrega controlada de medicamentos, microagulhas de uso médico, memórias ópticas de dimensões micro ou nanométricas, microplataformas para crescimento de tecidos biológicos, microguias de onda em aparelhos de telecomunicações e minúsculos elementos para sistemas de processamento de informações, como os ainda inéditos computadores ópticos.
Laboratório no IFSC: estruturas diminutas para uso na eletrônica e na medicina
© IFSC/USP
Denominada de fotopolimerização por absorção de dois fótons, a técnica é muito recente e foi proposta em 1997 pelo pesquisador japonês Satoshi Kawata, professor especializado em nanotecnologia da Universidade de Osaka. Apenas em 2001, com a publicação de um artigo na revista Nature pelo grupo de Kawata, ela ganhou projeção nos meios científicos internacionais. Atual mente, poucos grupos de pesquisa no mundo, notadamente no Japão, Estados Unidos, Alemanha e Coreia do Sul, conseguem reproduzi-la, incluindo agora o Brasil com o grupo de São Carlos.
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Técnica permite criar micro e nanoestruturas poliméricas de geometria complexa
Yuri Vasconcelos
Edição Impressa 165 - Novembro 2009
Pesquisa FAPESP - A utilização do laser na medicina, nas cirurgias de olhos, por exemplo, e nas telecomunicações, no interior das fibras ópticas, já é bem conhecida. Mas os vários tipos de laser ainda podem ser mais explorados em outras atividades. Atualmente o que se busca na pesquisa científica e tecnológica com esses feixes concentrados de luz é o uso mais ampliado nas escalas de tamanho em micrômetros e nanômetros. Nesse sentido, um passo importante foi dado por pesquisadores do Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo (IFSC/USP). Em parceria com um grupo de pesquisadores da Universidade Harvard, nos Estados Unidos, eles dominaram a técnica óptica que utiliza pulsos ultracurtos de luz laser para fabricar estruturas poliméricas tridimensionais e de geometria complexa que não se podem ver a olho nu. O domínio desse novo processo permitirá, no futuro, a fabricação de dispositivos miniaturizados para circuitos elétricos, microcápsulas para entrega controlada de medicamentos, microagulhas de uso médico, memórias ópticas de dimensões micro ou nanométricas, microplataformas para crescimento de tecidos biológicos, microguias de onda em aparelhos de telecomunicações e minúsculos elementos para sistemas de processamento de informações, como os ainda inéditos computadores ópticos.
Laboratório no IFSC: estruturas diminutas para uso na eletrônica e na medicina
© IFSC/USP
Denominada de fotopolimerização por absorção de dois fótons, a técnica é muito recente e foi proposta em 1997 pelo pesquisador japonês Satoshi Kawata, professor especializado em nanotecnologia da Universidade de Osaka. Apenas em 2001, com a publicação de um artigo na revista Nature pelo grupo de Kawata, ela ganhou projeção nos meios científicos internacionais. Atual mente, poucos grupos de pesquisa no mundo, notadamente no Japão, Estados Unidos, Alemanha e Coreia do Sul, conseguem reproduzi-la, incluindo agora o Brasil com o grupo de São Carlos.
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A teoria ecológica de especiação dos Grants, mas nenhum apoio para o darwinismo
Uma teoria ecológica de especiação, mas nenhum apoio para o darwinismo
por David Tyler 08:11:38 am
Uma teoria ecológica de especiação, mas nenhum apoio para o darwinismo
As ilhas Galápagos têm sido há muito tempo reconhecidas como o lar de numerosas espécies endêmicas, e de perguntas estimulantes sobre como tais espécies passaram a existir. Aqueles que respondem com perguntas têm apoiado suas opiniões mais pela teoria do que pela observação. Mas Peter e Rosemary Grant são diferentes, porque eles foram os pioneiros nos estudos longitudinais dos tentilhões de Galápagos, particularmente na pequena (e relativamente isolada) ilha de Daphne Maior. Um novo estudo de um tentilhão macho que vive no solo (Geospiza fortis) cobre o período de 1981 até o presente.
“We have followed the survival and reproduction of this individual and all of its known descendants, here termed the immigrant lineage, for seven generations (F0 to F6) spanning 28 years.”
[Nós acompanhamos a sobrevivência e a reprodução deste indivíduo e de todos os seus descendentes conhecidos, aqui nomeados de linhagem imigrante, por sete gerações (F0 e F6) ao longo de 28 anos].
Este bico e canto estranhos deste tentilhão o torna impopular com os tentilhões locais. (Fonte: Peter Grant/PNAS)
Os Grants observaram um aglomerado de territórios de machos da linhagem imigrante e estabeleceram que estas aves formaram uma nova, ainda que pequena, população que cruza. A história diz respeito a intercruzamento seguido de endogamia. Os autores consideram que eles ganharam um “insight importante no processo de especiação” — embora eles se apressem em acrescentar que eles não consideram essas aves como uma nova espécie.
“How many generations of exclusively within-group mating are needed before the group is recognized as a separate species that deserves taxonomic status? There is no nonarbitrary answer. We treat the endogamous group as an incipient species because it has been reproductively isolated from sympatric G. fortis for three generations and possibly longer.”
[Quantas gerações de grupo exclusivamente cruzador entre si são necessárias antes que o grupo seja reconhecido como uma espécie separada que mereça status taxonômico? Não existe nenhuma resposta não arbitrária. Nós consideramos o grupo endógamo como uma espécie incipiente porque ele tem ficado reprodutivamente isolado do grupo simpátrico G. fortis por três gerações e, possivelmente, muitas mais.”
Isto não é uma história envolvendo novas mutações, ou qualquer mudança genética significante fora do limite normal dos tentilhões do solo. Ela é relevante para discussão de especiação simpátrica, porque a nova população coexiste com outros tentilhões do solo medianos na mesma ilha e o intercruzamento ocorreu nas primeiras gerações da linhagem. Então, quais fatores estão associados com uma barreira para o intercruzamento? Os Grants identificam dois fatores: um é morfológico (os imigrantes têm dimensões maiores de bicos) e outro fator é o canto (os imigrantes diferem do canto dos residentes com uma freqüência máxima mais baixa e uma taxa de repetição de nota muito maior).
“Our observations provide insight into speciation and hence, into the origin of a new species. They show how a barrier to interbreeding can arise behaviorally and without genetic change in sympatry. A necessary condition was prior ecological divergence, and introgressive hybridization was possibly another. Evidently it takes only a single diploid immigrant to start the process by breeding with a resident, and tolerance of the effects of inbreeding is needed to complete it.”
[As nossas observações forncem insight na especiação e, por isso, na origem de uma nova espécie. Elas mostram como que uma barreira ao intercruzamento pode surgir em termos comportamentais e sem mudança genética na simpatria. Uma condição necessária aconteceu antes da divergência ecológica, e a hibridização intogressiva possivelmente foi outra. Evidentemente, é necessário apenas um só imigrante diplóide para começar o processo cruzando com um residente, e a tolerância dos efeitos de intercruzamento é necessária para completá-lo]
Estas observações, e a emergência da perspective ecológica da especiação é interessante — mas como que isso se relaciona com mais questões encontradas pelos biólogos evolucionistas? Em particular, isso ajuda a entender como que ocorre a inovação? A resposta deve ser — não. Não existem mudanças genéticas que possam ser associadas a novas características e, embora, atualmente esta população esteja isolada reprodutivamente, alguns traumas ambientais podem facilmente resultar numa unificação. O darwinismo está exatamente onde sempre esteve — explicando a origem da complexidade pelo apelo à teoria e à imaginação.
Por outro lado, estes dados podem ser entendidos facilmente em termos de especiação por redução do pool genético. Embora normalmente apresentado em termos de alopatria, este modelo considera a possível perda de alelos quando uma população que cruza se divide. As populações resultantes podem não ter a diversidade genética da população original, e embora isto possa funcionar em mudança ambiental de curta duração, a mudança ambiental pode revelar que as populações resultantes são inadequadas e o resultado final pode ser a extinção. Claramente, esta perspective sobre os dados não tem nada a dar para o darwinismo, mas é compatível com diversas perspectivas não darwinianas de especiação.
Os relatórios de ciência relevantes para a teoria evolucionária podem se degenerar ao nível de torcida a favor de uma causa favorita. Uma explicação da pesquisa dos Grants se refere a “a real-time record of evolution in action. In the PNAS paper, they describe something Darwin could only have dreamed of watching: the birth of a new species.” [um registro ao vivo da evolução em ação. No artigo do PNAS, eles descrevem algo que Darwin somente teria sonhado em observar: o nascimento de uma nova espécie]. Para mais detalhes, queira se reportar aos comentários de Jonathan Wells aqui.
The secondary contact phase of allopatric speciation in Darwin's finches
Peter R. Grant and B. Rosemary Grant
Proceedings of the National Academy of Sciences, Early Edition, Nov. 16, 2009 | doi 10.1073/pnas.0911761106
Abstract: Speciation, the process by which two species form from one, involves the development of reproductive isolation of two divergent lineages. Here, we report the establishment and persistence of a reproductively isolated population of Darwin's finches on the small Galapagos Island of Daphne Major in the secondary contact phase of speciation. In 1981, an immigrant medium ground finch (Geospiza fortis) arrived on the island. It was unusually large, especially in beak width, sang an unusual song, and carried some Geospiza scandens alleles. We followed the fate of this individual and its descendants for seven generations over a period of 28 years. In the fourth generation, after a severe drought, the lineage was reduced to a single brother and sister, who bred with each other. From then on this lineage, inheriting unusual song, morphology, and a uniquely homozygous marker allele, was reproductively isolated, because their own descendants bred with each other and with no other member of the resident G. fortis population. These observations agree with some expectations of an ecological theory of speciation in that a barrier to interbreeding arises as a correlated effect of adaptive divergence in morphology. However, the important, culturally transmitted, song component of the barrier appears to have arisen by chance through an initial imperfect copying of local song by the immigrant. The study reveals additional stochastic elements of speciation, in which divergence is initiated in allopatry; immigration to a new area of a single male hybrid and initial breeding with a rare hybrid female
See also:
Cressey, D. Darwin's finches tracked to reveal evolution in action, Nature News (16 November 2009) | doi:10.1038/news.2009.1089
+++++
1. A Nomenklatura científica adverte:
Ler este blog todos os dias pode facilmente desviá-lo dos Caminhos de Down.
2. Segundo os critérios orwellianos do Research Blogging, esta postagem não é científica.
por David Tyler 08:11:38 am
Uma teoria ecológica de especiação, mas nenhum apoio para o darwinismo
As ilhas Galápagos têm sido há muito tempo reconhecidas como o lar de numerosas espécies endêmicas, e de perguntas estimulantes sobre como tais espécies passaram a existir. Aqueles que respondem com perguntas têm apoiado suas opiniões mais pela teoria do que pela observação. Mas Peter e Rosemary Grant são diferentes, porque eles foram os pioneiros nos estudos longitudinais dos tentilhões de Galápagos, particularmente na pequena (e relativamente isolada) ilha de Daphne Maior. Um novo estudo de um tentilhão macho que vive no solo (Geospiza fortis) cobre o período de 1981 até o presente.
“We have followed the survival and reproduction of this individual and all of its known descendants, here termed the immigrant lineage, for seven generations (F0 to F6) spanning 28 years.”
[Nós acompanhamos a sobrevivência e a reprodução deste indivíduo e de todos os seus descendentes conhecidos, aqui nomeados de linhagem imigrante, por sete gerações (F0 e F6) ao longo de 28 anos].
Este bico e canto estranhos deste tentilhão o torna impopular com os tentilhões locais. (Fonte: Peter Grant/PNAS)
Os Grants observaram um aglomerado de territórios de machos da linhagem imigrante e estabeleceram que estas aves formaram uma nova, ainda que pequena, população que cruza. A história diz respeito a intercruzamento seguido de endogamia. Os autores consideram que eles ganharam um “insight importante no processo de especiação” — embora eles se apressem em acrescentar que eles não consideram essas aves como uma nova espécie.
“How many generations of exclusively within-group mating are needed before the group is recognized as a separate species that deserves taxonomic status? There is no nonarbitrary answer. We treat the endogamous group as an incipient species because it has been reproductively isolated from sympatric G. fortis for three generations and possibly longer.”
[Quantas gerações de grupo exclusivamente cruzador entre si são necessárias antes que o grupo seja reconhecido como uma espécie separada que mereça status taxonômico? Não existe nenhuma resposta não arbitrária. Nós consideramos o grupo endógamo como uma espécie incipiente porque ele tem ficado reprodutivamente isolado do grupo simpátrico G. fortis por três gerações e, possivelmente, muitas mais.”
Isto não é uma história envolvendo novas mutações, ou qualquer mudança genética significante fora do limite normal dos tentilhões do solo. Ela é relevante para discussão de especiação simpátrica, porque a nova população coexiste com outros tentilhões do solo medianos na mesma ilha e o intercruzamento ocorreu nas primeiras gerações da linhagem. Então, quais fatores estão associados com uma barreira para o intercruzamento? Os Grants identificam dois fatores: um é morfológico (os imigrantes têm dimensões maiores de bicos) e outro fator é o canto (os imigrantes diferem do canto dos residentes com uma freqüência máxima mais baixa e uma taxa de repetição de nota muito maior).
“Our observations provide insight into speciation and hence, into the origin of a new species. They show how a barrier to interbreeding can arise behaviorally and without genetic change in sympatry. A necessary condition was prior ecological divergence, and introgressive hybridization was possibly another. Evidently it takes only a single diploid immigrant to start the process by breeding with a resident, and tolerance of the effects of inbreeding is needed to complete it.”
[As nossas observações forncem insight na especiação e, por isso, na origem de uma nova espécie. Elas mostram como que uma barreira ao intercruzamento pode surgir em termos comportamentais e sem mudança genética na simpatria. Uma condição necessária aconteceu antes da divergência ecológica, e a hibridização intogressiva possivelmente foi outra. Evidentemente, é necessário apenas um só imigrante diplóide para começar o processo cruzando com um residente, e a tolerância dos efeitos de intercruzamento é necessária para completá-lo]
Estas observações, e a emergência da perspective ecológica da especiação é interessante — mas como que isso se relaciona com mais questões encontradas pelos biólogos evolucionistas? Em particular, isso ajuda a entender como que ocorre a inovação? A resposta deve ser — não. Não existem mudanças genéticas que possam ser associadas a novas características e, embora, atualmente esta população esteja isolada reprodutivamente, alguns traumas ambientais podem facilmente resultar numa unificação. O darwinismo está exatamente onde sempre esteve — explicando a origem da complexidade pelo apelo à teoria e à imaginação.
Por outro lado, estes dados podem ser entendidos facilmente em termos de especiação por redução do pool genético. Embora normalmente apresentado em termos de alopatria, este modelo considera a possível perda de alelos quando uma população que cruza se divide. As populações resultantes podem não ter a diversidade genética da população original, e embora isto possa funcionar em mudança ambiental de curta duração, a mudança ambiental pode revelar que as populações resultantes são inadequadas e o resultado final pode ser a extinção. Claramente, esta perspective sobre os dados não tem nada a dar para o darwinismo, mas é compatível com diversas perspectivas não darwinianas de especiação.
Os relatórios de ciência relevantes para a teoria evolucionária podem se degenerar ao nível de torcida a favor de uma causa favorita. Uma explicação da pesquisa dos Grants se refere a “a real-time record of evolution in action. In the PNAS paper, they describe something Darwin could only have dreamed of watching: the birth of a new species.” [um registro ao vivo da evolução em ação. No artigo do PNAS, eles descrevem algo que Darwin somente teria sonhado em observar: o nascimento de uma nova espécie]. Para mais detalhes, queira se reportar aos comentários de Jonathan Wells aqui.
The secondary contact phase of allopatric speciation in Darwin's finches
Peter R. Grant and B. Rosemary Grant
Proceedings of the National Academy of Sciences, Early Edition, Nov. 16, 2009 | doi 10.1073/pnas.0911761106
Abstract: Speciation, the process by which two species form from one, involves the development of reproductive isolation of two divergent lineages. Here, we report the establishment and persistence of a reproductively isolated population of Darwin's finches on the small Galapagos Island of Daphne Major in the secondary contact phase of speciation. In 1981, an immigrant medium ground finch (Geospiza fortis) arrived on the island. It was unusually large, especially in beak width, sang an unusual song, and carried some Geospiza scandens alleles. We followed the fate of this individual and its descendants for seven generations over a period of 28 years. In the fourth generation, after a severe drought, the lineage was reduced to a single brother and sister, who bred with each other. From then on this lineage, inheriting unusual song, morphology, and a uniquely homozygous marker allele, was reproductively isolated, because their own descendants bred with each other and with no other member of the resident G. fortis population. These observations agree with some expectations of an ecological theory of speciation in that a barrier to interbreeding arises as a correlated effect of adaptive divergence in morphology. However, the important, culturally transmitted, song component of the barrier appears to have arisen by chance through an initial imperfect copying of local song by the immigrant. The study reveals additional stochastic elements of speciation, in which divergence is initiated in allopatry; immigration to a new area of a single male hybrid and initial breeding with a rare hybrid female
See also:
Cressey, D. Darwin's finches tracked to reveal evolution in action, Nature News (16 November 2009) | doi:10.1038/news.2009.1089
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1. A Nomenklatura científica adverte:
Ler este blog todos os dias pode facilmente desviá-lo dos Caminhos de Down.
2. Segundo os critérios orwellianos do Research Blogging, esta postagem não é científica.
O trabalho enfadonho de encontrar genes homólogos de RNA não codificantes
The tedious task of finding homologous noncoding RNA genes
Peter Menzel1,2, Jan Gorodkin1 and Peter F. Stadler2,3,4,5,6
- Author Affiliations
1Section for Genetics and Bioinformatics, IBHV, and Center for Applied Bioinformatics, University of Copenhagen, DK-1870 Frederiksberg, Denmark
2Bioinformatics Group, Department of Computer Science, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, D-04107 Leipzig, Germany
3Max Planck Institute for Mathematics in the Sciences, D-04103 Leipzig, Germany
4RNomics Group, Fraunhofer Institut für Zelltherapie und Immunologie, D-04103 Leipzig, Germany
5Santa Fe Institute, Santa Fe, New Mexico 87501, USA
6Department of Theoretical Chemistry, University of Vienna, A-1090 Wien, Austria
Abstract
User-driven in silico RNA homology search is still a nontrivial task. In part, this is the consequence of a limited precision of the computational tools in spite of recent exciting progress in this area, and to a certain extent, computational costs are still problematic in practice. An important, and as we argue here, dominating issue is the dependence on good curated (secondary) structural alignments of the RNAs. These are often hard to obtain, not so much because of an inherent limitation in the available data, but because they require substantial manual curation, an effort that is rarely acknowledged. Here, we qualitatively describe a realistic scenario for what a “regular user” (i.e., a nonexpert in a particular RNA family) can do in practice, and what kind of results are likely to be achieved. Despite the indisputable advances in computational RNA biology, the conclusion is discouraging: BLAST still works better or equally good as other methods unless extensive expert knowledge on the RNA family is included. However, when good curated data are available the recent development yields further improvements in finding remote homologs. Homology search beyond the reach of BLAST hence is not at all a routine task.
Keywords:
RNA secondary structure prediction noncoding RNA homology search RNA structural alignments
Footnotes
Reprint requests to: Peter F. Stadler, Bioinformatics Group, Department of Computer Science, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, Härtelstraße 16-18, D-04107 Leipzig, Germany; e-mail: peter.stadler@bioinf.uni-leipzig.de; fax: +49-341-97-16709.
Article published online ahead of print. Article and publication date are at http://www.rnajournal.org/cgi/doi/10.1261/rna.1556009.
Copyright © 2009 RNA Society
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Professores, pesquisadores e alunos de universidades públicas e privadas com acesso ao site CAPES/Periódicos podem ler gratuitamente este artigo da RNA e de outras publicações científicas.
Peter Menzel1,2, Jan Gorodkin1 and Peter F. Stadler2,3,4,5,6
- Author Affiliations
1Section for Genetics and Bioinformatics, IBHV, and Center for Applied Bioinformatics, University of Copenhagen, DK-1870 Frederiksberg, Denmark
2Bioinformatics Group, Department of Computer Science, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, D-04107 Leipzig, Germany
3Max Planck Institute for Mathematics in the Sciences, D-04103 Leipzig, Germany
4RNomics Group, Fraunhofer Institut für Zelltherapie und Immunologie, D-04103 Leipzig, Germany
5Santa Fe Institute, Santa Fe, New Mexico 87501, USA
6Department of Theoretical Chemistry, University of Vienna, A-1090 Wien, Austria
Abstract
User-driven in silico RNA homology search is still a nontrivial task. In part, this is the consequence of a limited precision of the computational tools in spite of recent exciting progress in this area, and to a certain extent, computational costs are still problematic in practice. An important, and as we argue here, dominating issue is the dependence on good curated (secondary) structural alignments of the RNAs. These are often hard to obtain, not so much because of an inherent limitation in the available data, but because they require substantial manual curation, an effort that is rarely acknowledged. Here, we qualitatively describe a realistic scenario for what a “regular user” (i.e., a nonexpert in a particular RNA family) can do in practice, and what kind of results are likely to be achieved. Despite the indisputable advances in computational RNA biology, the conclusion is discouraging: BLAST still works better or equally good as other methods unless extensive expert knowledge on the RNA family is included. However, when good curated data are available the recent development yields further improvements in finding remote homologs. Homology search beyond the reach of BLAST hence is not at all a routine task.
Keywords:
RNA secondary structure prediction noncoding RNA homology search RNA structural alignments
Footnotes
Reprint requests to: Peter F. Stadler, Bioinformatics Group, Department of Computer Science, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, Härtelstraße 16-18, D-04107 Leipzig, Germany; e-mail: peter.stadler@bioinf.uni-leipzig.de; fax: +49-341-97-16709.
Article published online ahead of print. Article and publication date are at http://www.rnajournal.org/cgi/doi/10.1261/rna.1556009.
Copyright © 2009 RNA Society
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Professores, pesquisadores e alunos de universidades públicas e privadas com acesso ao site CAPES/Periódicos podem ler gratuitamente este artigo da RNA e de outras publicações científicas.
Climategate: Manchetes no mundo todo. No Brasil...
por Redação Mídia@Mais em 24 de novembro de 2009 Destaques - Clipping
Climategate: Manchetes no mundo todo. No Brasil...
Uma vez que todos os emails têm como destinatários universidades públicas americanas, são públicos, ou seja, têm divulgação protegida pelo FOIA – Freedom of Information Act. Mas no resto do mundo, a busca por evidências de fraude é frenética. Enquanto isso, os diretores do CRU e seus aliados na grande mídia catastrofista tentam minimizar o vazamento ou caracterizá-lo como “manobra” dos céticos. Aliás, FOIA 2009 é o nome do arquivo compactado que está batendo recordes de downloads mundo afora. É um “Climategate” em gestação avançada, apesar dos esforços em abortá-lo.
CRU –Climate Research Unit, University of East Anglia, Inglaterra, cujo sistema de computadores foi invadido por um hacker, que copiou mais de 60 MB de arquivos e os postou na Internet, incluindo cerca de 1.000 (mil) emails.
Mas enquanto as intenções hacker (ou mesmo de um vazamento proposital por parte de algum membro do próprio CRU, descontente com os rumos da política interna do centro de pesquisas) e principalmente o teor dos emails são assunto de discussão em grandes jornais e redes de TV mundo afora, no Brasil apenas alguns blogs deram a notícia, além, é claro, de uma breve citação da ultra-verde BBC Brasil. O único site brasileiro que dedicou maior espaço e atenção ao assunto foi o Mídia@Mais.
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Climategate: Manchetes no mundo todo. No Brasil...
Uma vez que todos os emails têm como destinatários universidades públicas americanas, são públicos, ou seja, têm divulgação protegida pelo FOIA – Freedom of Information Act. Mas no resto do mundo, a busca por evidências de fraude é frenética. Enquanto isso, os diretores do CRU e seus aliados na grande mídia catastrofista tentam minimizar o vazamento ou caracterizá-lo como “manobra” dos céticos. Aliás, FOIA 2009 é o nome do arquivo compactado que está batendo recordes de downloads mundo afora. É um “Climategate” em gestação avançada, apesar dos esforços em abortá-lo.
CRU –Climate Research Unit, University of East Anglia, Inglaterra, cujo sistema de computadores foi invadido por um hacker, que copiou mais de 60 MB de arquivos e os postou na Internet, incluindo cerca de 1.000 (mil) emails.
Mas enquanto as intenções hacker (ou mesmo de um vazamento proposital por parte de algum membro do próprio CRU, descontente com os rumos da política interna do centro de pesquisas) e principalmente o teor dos emails são assunto de discussão em grandes jornais e redes de TV mundo afora, no Brasil apenas alguns blogs deram a notícia, além, é claro, de uma breve citação da ultra-verde BBC Brasil. O único site brasileiro que dedicou maior espaço e atenção ao assunto foi o Mídia@Mais.
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Falta de recursos é desafio para a divulgação científica no Museu Goeldi
Falta de recursos é desafio para a divulgação científica no Museu Goeldi
Por Fernanda Vasconcelos
24/11/2009
As atividades de comunicação científica do Museu Paraense Emílio Goeldi (MPEG) estão institucionalizadas há 25 anos e contam, atualmente, com diferentes meios de divulgação e ampla produção científica. Ainda assim, sofrem com a falta de recursos financeiros, como afirmou a jornalista Jimena Felipe Beltrão, da assessoria de comunicação do MPEG, em palestra realizada durante o Foro Iberoamericano de Comunicação e Divulgação Científica, dia 23, na Unicamp.
Beltrão apresentou o projeto “Ciência e sociedade: comunicação e educação para a preservação ambiental e cultural na Amazônia oriental brasileira”, uma proposta de consolidação das atividades de comunicação social do MPGE. Além de atuar na formação de recursos humanos para a divulgação de ciência e no desenvolvimento de pesquisas, a Agência Museu Goeldi é responsável, atualmente, pela produção do boletim semanal Museu Em Pauta (que disponibiliza sugestões de matérias para divulgação do museu e de outras instituições parceiras), pelo Clipping do Dia (apanhado diário de notícias relacionadas a ciência, tecnologia e meio ambiente), e pelo jornal Destaque Amazônia (que se propõe não só a divulgar as atividades do MPGE mas, também, de outras instituições).
Entre os objetivos da comunicação científica do MPGE, Beltrão destacou o estímulo ao interesse da sociedade por temas científicos e a promoção dos valores de preservação ambiental e cultural. Na avaliação da jornalista, as metas são atingidas. Beltrão destaca que pelo menos cinco pautas são disponibilizadas semanalmente para os demais veículos de comunicação e que a repercussão é monitorada. “Nós temos como verificar quais as pautas enviadas pela agência têm tido ressonância nos veículos”, explica a jornalista. “Como trabalhamos temáticas relativas à região e questões flagrantemente conflituosas e complicadas, como espécies ameaçadas, desmatamento, perda cultural dos registros de sociedades antigas e perda das línguas tradicionais das populações indígenas, há todo um trabalho de recuperação dessa cultura tradicional e de divulgação. Trabalhando com essa diversidade e fazendo um monitoramento, nós alcançamos os objetivos da divulgação dos valores de preservação ambiental e cultural”, completa.
O Destaque Amazônia é a menina dos olhos da agência do MPGE, segundo Beltrão. “É uma forma de nós tentarmos manter viva a produção da notícia de conteúdo científico e a formação dos recursos humanos, e alcançar a sociedade da forma mais abrangente possível”, defende a jornalista, ao afirmar que o jornal, disponível nas versões impressa e eletrônica, é divulgado a todas as escolas particulares e públicas do estado do Pará e a todos os museus brasileiros. No entanto, a procura por maior abrangência na cobertura de assuntos científicos relativos à Amazônia esbarra nas dificuldades de produção. “A região é imensa e a gente não tem recursos direcionados para reportagens. As dificuldades são muito grandes”, explica a jornalista. Ela destaca que o jornal é publicado a cada dois meses, não por falta de material, mas de recursos.
Ao argumentar que, a cada mandato dentro dos museus de história natural, dirigentes privilegiam diferentes áreas da instituição, Beltrão chamou a atenção para a falta de compromisso institucional com a área de comunicação, que passou por um período de pouco apoio no MPGE. Recentemente, recursos originados no Ministério da Ciência e Tecnologia (MCT) possibilitaram a melhorias de infra-estrutura e contribuíram para a formação de recursos humanos e a organização da produção jornalística do museu. No entanto, Beltrão destaca que bolsistas do Programa de Capacitação Institucional do MCT, que desenvolviam pesquisas e eram responsáveis por cerca de metade dos conteúdos de comunicação científica do MPGE, perderam o benefício. “Infelizmente, isso aconteceu por conta de uma avaliação feita na burocracia do ministério, que coordena o Programa de Capacitação Institucional. Eles consideram que a comunicação, o jornalismo, não faz pesquisa. Esse foi o parecer e as bolsas foram cortadas”, afirma a jornalista.
Para argumentar contra a avaliação, Beltrão destacou os produtos das pesquisas na área de comunicação realizadas no MPGE. A produção científica inclui apresentações de trabalhos em eventos, publicação de artigos e capítulos de livros e a organização de um volume com seis dossiês sobre temáticas amazônicas, feito a partir da análise da cobertura da imprensa no período de 2000 a 2005, que será publicado em breve.
Mais informações no site do Museu Paraense Emílio Goeldi.
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NOTA DESTE BLOGGER:
Eu visitei o Museu Paraense Emílio Goeldi em 2009. Dois desafios:
1. Se fosse mais jovem, eu iria estudar ali. Fica aqui o desafio aos universitários que lêem este blog.
2. É preciso levantar mais recursos para a divulgação científica deste nosso museu.
Por Fernanda Vasconcelos
24/11/2009
As atividades de comunicação científica do Museu Paraense Emílio Goeldi (MPEG) estão institucionalizadas há 25 anos e contam, atualmente, com diferentes meios de divulgação e ampla produção científica. Ainda assim, sofrem com a falta de recursos financeiros, como afirmou a jornalista Jimena Felipe Beltrão, da assessoria de comunicação do MPEG, em palestra realizada durante o Foro Iberoamericano de Comunicação e Divulgação Científica, dia 23, na Unicamp.
Beltrão apresentou o projeto “Ciência e sociedade: comunicação e educação para a preservação ambiental e cultural na Amazônia oriental brasileira”, uma proposta de consolidação das atividades de comunicação social do MPGE. Além de atuar na formação de recursos humanos para a divulgação de ciência e no desenvolvimento de pesquisas, a Agência Museu Goeldi é responsável, atualmente, pela produção do boletim semanal Museu Em Pauta (que disponibiliza sugestões de matérias para divulgação do museu e de outras instituições parceiras), pelo Clipping do Dia (apanhado diário de notícias relacionadas a ciência, tecnologia e meio ambiente), e pelo jornal Destaque Amazônia (que se propõe não só a divulgar as atividades do MPGE mas, também, de outras instituições).
Entre os objetivos da comunicação científica do MPGE, Beltrão destacou o estímulo ao interesse da sociedade por temas científicos e a promoção dos valores de preservação ambiental e cultural. Na avaliação da jornalista, as metas são atingidas. Beltrão destaca que pelo menos cinco pautas são disponibilizadas semanalmente para os demais veículos de comunicação e que a repercussão é monitorada. “Nós temos como verificar quais as pautas enviadas pela agência têm tido ressonância nos veículos”, explica a jornalista. “Como trabalhamos temáticas relativas à região e questões flagrantemente conflituosas e complicadas, como espécies ameaçadas, desmatamento, perda cultural dos registros de sociedades antigas e perda das línguas tradicionais das populações indígenas, há todo um trabalho de recuperação dessa cultura tradicional e de divulgação. Trabalhando com essa diversidade e fazendo um monitoramento, nós alcançamos os objetivos da divulgação dos valores de preservação ambiental e cultural”, completa.
O Destaque Amazônia é a menina dos olhos da agência do MPGE, segundo Beltrão. “É uma forma de nós tentarmos manter viva a produção da notícia de conteúdo científico e a formação dos recursos humanos, e alcançar a sociedade da forma mais abrangente possível”, defende a jornalista, ao afirmar que o jornal, disponível nas versões impressa e eletrônica, é divulgado a todas as escolas particulares e públicas do estado do Pará e a todos os museus brasileiros. No entanto, a procura por maior abrangência na cobertura de assuntos científicos relativos à Amazônia esbarra nas dificuldades de produção. “A região é imensa e a gente não tem recursos direcionados para reportagens. As dificuldades são muito grandes”, explica a jornalista. Ela destaca que o jornal é publicado a cada dois meses, não por falta de material, mas de recursos.
Ao argumentar que, a cada mandato dentro dos museus de história natural, dirigentes privilegiam diferentes áreas da instituição, Beltrão chamou a atenção para a falta de compromisso institucional com a área de comunicação, que passou por um período de pouco apoio no MPGE. Recentemente, recursos originados no Ministério da Ciência e Tecnologia (MCT) possibilitaram a melhorias de infra-estrutura e contribuíram para a formação de recursos humanos e a organização da produção jornalística do museu. No entanto, Beltrão destaca que bolsistas do Programa de Capacitação Institucional do MCT, que desenvolviam pesquisas e eram responsáveis por cerca de metade dos conteúdos de comunicação científica do MPGE, perderam o benefício. “Infelizmente, isso aconteceu por conta de uma avaliação feita na burocracia do ministério, que coordena o Programa de Capacitação Institucional. Eles consideram que a comunicação, o jornalismo, não faz pesquisa. Esse foi o parecer e as bolsas foram cortadas”, afirma a jornalista.
Para argumentar contra a avaliação, Beltrão destacou os produtos das pesquisas na área de comunicação realizadas no MPGE. A produção científica inclui apresentações de trabalhos em eventos, publicação de artigos e capítulos de livros e a organização de um volume com seis dossiês sobre temáticas amazônicas, feito a partir da análise da cobertura da imprensa no período de 2000 a 2005, que será publicado em breve.
Mais informações no site do Museu Paraense Emílio Goeldi.
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NOTA DESTE BLOGGER:
Eu visitei o Museu Paraense Emílio Goeldi em 2009. Dois desafios:
1. Se fosse mais jovem, eu iria estudar ali. Fica aqui o desafio aos universitários que lêem este blog.
2. É preciso levantar mais recursos para a divulgação científica deste nosso museu.
Agendas internacional e política determinam cobertura científica no país
Agendas internacional e política determinam cobertura científica no país
Por Fernanda Vasconcelos
24/11/2009
“A mídia é um gargalo”, afirmou o jornalista Gabriel Priolli, da Coordenação de Expansão e Rede da TV Cultura, durante mesa redonda realizada no Foro Iberoamericano de Divulgação Científica, dia 23, na Unicamp. Para Priolli, fazer comunicação na grande mídia é priorizar, escolher. E as escolhas que geram o atual estado da divulgação científica brasileira, um dos principais temas discutidos no evento, são pautadas, em sua maioria, pelas agendas internacional e política.
O jornalista da TV Cultura destaca o peso das publicações estrangeiras na divulgação do tema feita no Brasil. “Temos uma cobertura muito voltada à divulgação científica externa. A ciência de fora interessa mais que a ciência feita aqui”, argumenta Priolli, que classifica a situação como “submissão” e “servilismo”. O jornalista chamou atenção, ainda, para o fato de que aquilo que sai em revistas estrangeiras de renome, como a Science, acaba publicado novamente pela imprensa brasileira.
A influência internacional na seleção de assuntos voltados à ciência e à tecnologia pela mídia brasileira foi constatada em estudo apresentado por Fábio Senne, durante o evento. Coordenador da área de relações acadêmicas da Agência de Notícias dos Direitos da Criança (ANDI), Senne discutiu os principais resultados da pesquisa “Ciência, Tecnologia & Inovação na Mídia Brasileira”, realizada pela ANDI, em parceria com a Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa (Fundep). De acordo com o estudo, fruto do monitoramento da cobertura científica realizada por 62 veículos impressos brasileiros, publicações com abrangência nacional refletem em maior medida a agenda internacional. A tendência é menor nas publicações regionais e locais, que dão maior atenção às notícias associadas ao contexto brasileiro.
Além das publicações estrangeiras, a repercussão dos resultados de pesquisas e de eventos científicos está entre os principais fatores que determinam a escolha das notícias, de acordo com o estudo da ANDI. Em geral, temas ligados à saúde - em especial os resultados de pesquisas, como a descoberta de uma nova vacina - predominam na cobertura científica. Outros temas destacados pela imprensa estariam mais ligados a debates públicos pontuais. Foi o caso das mudanças climáticas, destaque na mídia em 2007, impulsionado principalmente pela divulgação de um relatório do Painel Intergovernamental Sobre Mudanças Climáticas (IPCC) e pelo Oscar ganho pelo ex-vice-presidente dos Estados Unidos, Al Gore, pelo filme Uma verdade inconveniente. Senne citou, ainda, o destaque à biotecnologia, no ano de 2008, devido aos debates no Supremo Tribunal Federal sobre a liberação das pesquisas com células-tronco embrionárias no país.
Para Priolli, da TV Cultura, a repercussão do debate das pesquisas com células-tronco demonstra o quanto a divulgação científica é pautada pela agenda política. No que se refere à influência dos eventos na cobertura jornalística de ciência e tecnologia, o jornalista destaca os 150 anos da publicação de A origem das espécies, de Charles Darwin, comemorados esta semana e abordados por diversos veículos de comunicação. Priolli argumentou que a semana de comemorações pelo aniversário da obra deveria chamar atenção para a pequena divulgação dada à ciência, em comparação à religião. O jornalista observou que a explicação do mundo sob a ótica religiosa é transmitida todos os dias na televisão, enquanto a versão evolucionista é divulgada eventualmente.
De acordo com o estudo apresentado por Senne, da ANDI, mais da metade das notícias sobre ciência publicadas nos veículos impressos brasileiros restringem-se à comunicação de fatos pontuais, sem contextualizar os assuntos abordados. Matérias que apontam incertezas nas conclusões das pesquisas, descrevem o contexto histórico e os novos desafios dos temas abordados ou discutem aspectos éticos da atividade científica são minoria.
Priolli, da TV Cultura, também destaca a falta de contextualização e acredita que a cobertura de ciência na grande mídia é superficial. Mas o jornalista avalia que a divulgação científica brasileira avança progressivamente, à medida que ganha espaço. Para Priolli, quanto mais a ciência se desenvolve, maior a particularização da área, que torna-se compreensível apenas para os especialistas - processo que destaca a enorme importância da divulgação científica, na opinião do jornalista. “Temos um paradoxo: quanto mais a ciência se desenvolve e se aprofunda, mais difícil fica a comunicação para o grande público e maior é o desafio para os profissionais da comunicação”, completa Priolli.
Por Fernanda Vasconcelos
24/11/2009
“A mídia é um gargalo”, afirmou o jornalista Gabriel Priolli, da Coordenação de Expansão e Rede da TV Cultura, durante mesa redonda realizada no Foro Iberoamericano de Divulgação Científica, dia 23, na Unicamp. Para Priolli, fazer comunicação na grande mídia é priorizar, escolher. E as escolhas que geram o atual estado da divulgação científica brasileira, um dos principais temas discutidos no evento, são pautadas, em sua maioria, pelas agendas internacional e política.
O jornalista da TV Cultura destaca o peso das publicações estrangeiras na divulgação do tema feita no Brasil. “Temos uma cobertura muito voltada à divulgação científica externa. A ciência de fora interessa mais que a ciência feita aqui”, argumenta Priolli, que classifica a situação como “submissão” e “servilismo”. O jornalista chamou atenção, ainda, para o fato de que aquilo que sai em revistas estrangeiras de renome, como a Science, acaba publicado novamente pela imprensa brasileira.
A influência internacional na seleção de assuntos voltados à ciência e à tecnologia pela mídia brasileira foi constatada em estudo apresentado por Fábio Senne, durante o evento. Coordenador da área de relações acadêmicas da Agência de Notícias dos Direitos da Criança (ANDI), Senne discutiu os principais resultados da pesquisa “Ciência, Tecnologia & Inovação na Mídia Brasileira”, realizada pela ANDI, em parceria com a Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa (Fundep). De acordo com o estudo, fruto do monitoramento da cobertura científica realizada por 62 veículos impressos brasileiros, publicações com abrangência nacional refletem em maior medida a agenda internacional. A tendência é menor nas publicações regionais e locais, que dão maior atenção às notícias associadas ao contexto brasileiro.
Além das publicações estrangeiras, a repercussão dos resultados de pesquisas e de eventos científicos está entre os principais fatores que determinam a escolha das notícias, de acordo com o estudo da ANDI. Em geral, temas ligados à saúde - em especial os resultados de pesquisas, como a descoberta de uma nova vacina - predominam na cobertura científica. Outros temas destacados pela imprensa estariam mais ligados a debates públicos pontuais. Foi o caso das mudanças climáticas, destaque na mídia em 2007, impulsionado principalmente pela divulgação de um relatório do Painel Intergovernamental Sobre Mudanças Climáticas (IPCC) e pelo Oscar ganho pelo ex-vice-presidente dos Estados Unidos, Al Gore, pelo filme Uma verdade inconveniente. Senne citou, ainda, o destaque à biotecnologia, no ano de 2008, devido aos debates no Supremo Tribunal Federal sobre a liberação das pesquisas com células-tronco embrionárias no país.
Para Priolli, da TV Cultura, a repercussão do debate das pesquisas com células-tronco demonstra o quanto a divulgação científica é pautada pela agenda política. No que se refere à influência dos eventos na cobertura jornalística de ciência e tecnologia, o jornalista destaca os 150 anos da publicação de A origem das espécies, de Charles Darwin, comemorados esta semana e abordados por diversos veículos de comunicação. Priolli argumentou que a semana de comemorações pelo aniversário da obra deveria chamar atenção para a pequena divulgação dada à ciência, em comparação à religião. O jornalista observou que a explicação do mundo sob a ótica religiosa é transmitida todos os dias na televisão, enquanto a versão evolucionista é divulgada eventualmente.
De acordo com o estudo apresentado por Senne, da ANDI, mais da metade das notícias sobre ciência publicadas nos veículos impressos brasileiros restringem-se à comunicação de fatos pontuais, sem contextualizar os assuntos abordados. Matérias que apontam incertezas nas conclusões das pesquisas, descrevem o contexto histórico e os novos desafios dos temas abordados ou discutem aspectos éticos da atividade científica são minoria.
Priolli, da TV Cultura, também destaca a falta de contextualização e acredita que a cobertura de ciência na grande mídia é superficial. Mas o jornalista avalia que a divulgação científica brasileira avança progressivamente, à medida que ganha espaço. Para Priolli, quanto mais a ciência se desenvolve, maior a particularização da área, que torna-se compreensível apenas para os especialistas - processo que destaca a enorme importância da divulgação científica, na opinião do jornalista. “Temos um paradoxo: quanto mais a ciência se desenvolve e se aprofunda, mais difícil fica a comunicação para o grande público e maior é o desafio para os profissionais da comunicação”, completa Priolli.
UFMG mostra como atua para ampliar a cultura científica da comunidade
UFMG mostra como atua para ampliar a cultura científica da comunidade
Por Alessandra Pancetti
24/11/2009
“Nossa missão é estabelecer uma conexão entre a cultura científica e a sociedade, considerando o conhecimento científico e tecnológico produzido dentro e fora da universidade, e sempre levando em conta o grande potencial da ciência de possibilitar o desenvolvimento da sociedade”, explica Jessica Norberto Rocha, coordenadora pedagógica do Centro de Difusão da Ciência (CDC) da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), durante sua apresentação no Foro Iberoamericano de Comunicação e Divulgação Científica, realizado na Unicamp.
Criado em 2006 e vinculado à Pró-Reitoria de Extensão da UFMG, o CDC desenvolve uma série de atividades voltadas para a difusão e popularização científica e tecnológica no estado de Minas Gerais. Segundo Rocha, o CDC se propõe a atuar em diversas áreas da divulgação, envolvendo “atividades acadêmicas na universidade em praticamente todas as áreas, várias faculdades, institutos e departamentos, sistema de ensino da educação primária, da educação básica com alunos e professores e a comunidade em geral”.
De acordo com ela, o projeto mais importante do CDC hoje é o Museu Itinerante Ponto que, localizado em uma unidade móvel, possibilitando o atendimento de escolas e cidades do interior, é um projeto pioneiro no estado de Minas Gerais. “Em cima desses questionamentos, ponto de entrada, ponto de saída, ponto de interrogação, ponto de exclamação, a gente vai trabalhar ciência e tecnologia em diversas comunidades, principalmente para escolas e professores de educação básica”, explica Rocha.
A ideia do Museu Itenerante Ponto é focar o tema ciência de forma abrangente, através de uma exposição a ser montada nas diversas cidades por onde o museu passar. “O Museu Itinerante tem um eixo central, que é água, terra, vida e homem, e dentro desses temas ele trabalha várias áreas. Por exemplo, dentro do tema terra, a gente trabalha com geologia, com astronomia. Dentro do tema homem, a gente trabalha com a engenharia, com a computação, que é o desenvolvimento científico e tecnológico do homem, mas a gente também trabalha com a área da biologia e da medicina, que é o corpo do homem, o homem como ser único”, completa a pesquisadora. Em cada cidade, o museu vai ficar de três a quatro dias, cobrindo duas cidades por mês.
Dentro de seu primeiro eixo de atividades, o CDC também desenvolve mais outros dois projetos com museus, o Museu de Morfologia e o Museu de História Natural, onde atividades interativas são desenvolvidas em áreas que incluem morfologia, ecologia e educação ambiental. Além dos museus, o CDC organiza uma série de outras atividades voltadas para a divulgação científica e tecnológica para todas as faixas etárias, que envolvem a organização de visitações às instalações da universidade, com atividades organizadas pelos alunos do Colégio Técnico e Centro Pedagógico (UFMG jovem), a organização de feiras de ciências da educação básica, a formação e atualização de alunos de graduação e professores para divulgação científica e a organização de eventos científicos abertos ao público. Outras informações sobre os projetos e atividades podem ser encontradas no site do CDC.
Por Alessandra Pancetti
24/11/2009
“Nossa missão é estabelecer uma conexão entre a cultura científica e a sociedade, considerando o conhecimento científico e tecnológico produzido dentro e fora da universidade, e sempre levando em conta o grande potencial da ciência de possibilitar o desenvolvimento da sociedade”, explica Jessica Norberto Rocha, coordenadora pedagógica do Centro de Difusão da Ciência (CDC) da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), durante sua apresentação no Foro Iberoamericano de Comunicação e Divulgação Científica, realizado na Unicamp.
Criado em 2006 e vinculado à Pró-Reitoria de Extensão da UFMG, o CDC desenvolve uma série de atividades voltadas para a difusão e popularização científica e tecnológica no estado de Minas Gerais. Segundo Rocha, o CDC se propõe a atuar em diversas áreas da divulgação, envolvendo “atividades acadêmicas na universidade em praticamente todas as áreas, várias faculdades, institutos e departamentos, sistema de ensino da educação primária, da educação básica com alunos e professores e a comunidade em geral”.
De acordo com ela, o projeto mais importante do CDC hoje é o Museu Itinerante Ponto que, localizado em uma unidade móvel, possibilitando o atendimento de escolas e cidades do interior, é um projeto pioneiro no estado de Minas Gerais. “Em cima desses questionamentos, ponto de entrada, ponto de saída, ponto de interrogação, ponto de exclamação, a gente vai trabalhar ciência e tecnologia em diversas comunidades, principalmente para escolas e professores de educação básica”, explica Rocha.
A ideia do Museu Itenerante Ponto é focar o tema ciência de forma abrangente, através de uma exposição a ser montada nas diversas cidades por onde o museu passar. “O Museu Itinerante tem um eixo central, que é água, terra, vida e homem, e dentro desses temas ele trabalha várias áreas. Por exemplo, dentro do tema terra, a gente trabalha com geologia, com astronomia. Dentro do tema homem, a gente trabalha com a engenharia, com a computação, que é o desenvolvimento científico e tecnológico do homem, mas a gente também trabalha com a área da biologia e da medicina, que é o corpo do homem, o homem como ser único”, completa a pesquisadora. Em cada cidade, o museu vai ficar de três a quatro dias, cobrindo duas cidades por mês.
Dentro de seu primeiro eixo de atividades, o CDC também desenvolve mais outros dois projetos com museus, o Museu de Morfologia e o Museu de História Natural, onde atividades interativas são desenvolvidas em áreas que incluem morfologia, ecologia e educação ambiental. Além dos museus, o CDC organiza uma série de outras atividades voltadas para a divulgação científica e tecnológica para todas as faixas etárias, que envolvem a organização de visitações às instalações da universidade, com atividades organizadas pelos alunos do Colégio Técnico e Centro Pedagógico (UFMG jovem), a organização de feiras de ciências da educação básica, a formação e atualização de alunos de graduação e professores para divulgação científica e a organização de eventos científicos abertos ao público. Outras informações sobre os projetos e atividades podem ser encontradas no site do CDC.
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